RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-202ENST00000409189 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-202ENST00000409189 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-202ENST00000409189 ZNF320A2RRD8 509 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-202ENST00000409189 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.91□□□□□ -1.62
CCL20-202ENST00000409189 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CCL20-202ENST00000409189 LGALS9O00182 355 aa4.91□□□□□ -1.62
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CCL20-202ENST00000409189 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.91□□□□□ -1.62
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CCL20-202ENST00000409189 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.91□□□□□ -1.62
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CCL20-202ENST00000409189 OR5I1Q13606 314 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 PRR27Q6MZM9 219 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 PRNTQ86SH4 94 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 C4orf3Q8WVX3 66 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 C17orf77Q96MU5 243 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 NRN1Q9NPD7 142 aa4.9□□□□□ -1.63
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CCL20-202ENST00000409189 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 TMEM213A2RRL7 107 aa4.89□□□□□ -1.63
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CCL20-202ENST00000409189 C5orf52A6NGY3 159 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 A8MWL6 223 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 UBE2CO00762 179 aa4.89□□□□□ -1.63
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CCL20-202ENST00000409189 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 HLA-DQA1P01909 254 aa4.89□□□□□ -1.63
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CCL20-202ENST00000409189 MT3P25713 68 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 HIST1H2BBP33778 126 aa4.89□□□□□ -1.63
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CCL20-202ENST00000409189 ZFP82Q8N141 532 aa4.89□□□□□ -1.63
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CCL20-202ENST00000409189 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 SMPXQ9UHP9 88 aa4.89□□□□□ -1.63
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CCL20-202ENST00000409189 A0A087WW49 117 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 XKRY2A2RUG3 117 aa4.88□□□□□ -1.63
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CCL20-202ENST00000409189 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 RPS20P60866 119 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
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CCL20-202ENST00000409189 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.88□□□□□ -1.63
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CCL20-202ENST00000409189 C16orf95Q9H693 158 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GW15 77 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GXF2 115 aa4.87□□□□□ -1.63
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