RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 I3L2K1 104 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 SPRY2O43597 315 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 CFC1BP0CG36 223 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 CFC1P0CG37 223 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 UBE2D1P51668 147 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 RNF182Q8N6D2 247 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 C21orf62Q9NYP8 219 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 CTSZQ9UBR2 303 aa9.55□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 M0QXV9 152 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 OVOL3O00110 214 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 IGLV1-44P01699 117 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 SLC25A15Q9Y619 301 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 A4D1N5 150 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 GFRALQ6UXV0 394 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF576Q9H609 170 aa9.54□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 DYNAPQ8N1N2 210 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 MDS2Q8NDY4 140 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 ADIPOQQ15848 244 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 LINC01620Q4KN68 170 aa9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa9.52□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 LINC01619G3V211 115 aa9.52□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 K7EIM0 57 aa9.52□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 THBDP07204 575 aa9.52□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.52□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 BAALCQ8WXS3 180 aa9.52□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM126AQ9H061 195 aa9.52□□□□□ -0.88
SZRD1-201ENST00000401088 GATA4P43694 442 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 PMVKQ15126 192 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM101Q96IK0 257 aa9.52□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 TEX22C9J3V5 150 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 ABCA4P78363 2273 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 A0A0J9YY99 117 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 PRAC2D3DTV9 90 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 CD7P09564 240 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.51□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 C11orf86A6NJI1 115 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 DUX3Q96PT4 197 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 WT1P19544 449 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 Q6ZS46 218 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 RASL10AQ92737 203 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 SPTBN2O15020 2390 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 J3QQQ9 107 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 ATP5J2P56134 94 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.5□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.49□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.49□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 LINC00311Q8N616 119 aa9.49□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 NRACQ8N912 160 aa9.49□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 TOMM6Q96B49 74 aa9.49□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 NPC2P61916 151 aa9.49□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 FAM27E3Q08E93 113 aa9.49□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.48□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 C17orf100A8MU93 164 aa9.48□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 TIMM23O14925 209 aa9.48□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 DSPP15924 2871 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 C16orf92Q96LL3 132 aa9.48□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 PRO3102Q9H379 93 aa9.48□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.48□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.48□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa9.47□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.47□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 TEX36Q5VZQ5 186 aa9.47□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 Q6Q795 121 aa9.47□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.47□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.47□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.47□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.47□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.47□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.46□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 TRAV17A0A0B4J275 112 aa9.46□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.46□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 IGHV3-30P01768 117 aa9.46□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.46□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa9.46□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 NBR2O15453 112 aa9.46□□□□□ -0.89
SZRD1-201ENST00000401088 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.9 ms