RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 PCNX3Q9H6A9 2034 aa13.52□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXE3Q13461 319 aa13.52□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 PMVKQ15126 192 aa13.52□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNRF2Q8NHG8 242 aa13.52□□□□□ -0.24
SH3BP4-202ENST00000392011 I3L3M4 83 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 ELANEP08246 267 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 GHRHP01286 108 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 C3orf56Q8N813 242 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 AZU1P20160 251 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 BLCAPP62952 87 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 I3L2K1 104 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 C2orf82Q6UX34 121 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 GNRH2O43555 120 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 PLXNB1O43157 2135 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV2-14P01704 120 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 LGALS9BQ3B8N2 356 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 LGALS9CQ6DKI2 356 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 CENPFP49454 3210 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 ADORA2A-AS1P86434 159 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 MED12LQ86YW9 2145 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 VWC2LB2RUY7 222 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 SS18Q15532 418 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 DEFB136Q30KP8 78 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM141Q96I45 108 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 F5H768 121 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 MAJINQ3KP22 176 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 J3QKU1 62 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 GP9P14770 177 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 CDPF1Q6NVV7 123 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 CFHR4Q92496 578 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 E7EUB6 86 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 LEPROTO15243 131 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 CTSGP08311 255 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 PRB1P04280 392 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 C9JAW5 83 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 NAV3Q8IVL0 2385 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 NRGNQ92686 78 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 DKK2Q9UBU2 259 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 COX8AP10176 69 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 VPREB3Q9UKI3 123 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 PYGO2Q9BRQ0 406 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 F8VRH5 84 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 HLA-DRB4P13762 266 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV1-47P01700 117 aa13.46□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 NPBQ8NG41 125 aa13.46□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP6V0BQ99437 205 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 H3BUA1 57 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 DAD1P61803 113 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 PFN2P35080 140 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 GAGE2BQ13066 116 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 GAGE2EQ4V326 116 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 OCIAD2Q56VL3 154 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ODF3L1Q8IXM7 274 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ANAPC13Q9BS18 74 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 GAGE2DQ9UEU5 116 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 Q8N9W7 124 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF747Q9BV97 191 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 NUPR1O60356 82 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 GAGE6Q13070 117 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 MSRB1Q9NZV6 116 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 AJUBAQ96IF1 538 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 Q8N7P7 452 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 Q8NA96 180 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 C20orf78Q9BR46 151 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM243Q9BU79 118 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 NDUFA12Q9UI09 145 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV2-23P01705 113 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 BUB3O43684 328 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 PROP1O75360 226 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZPA2 131 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TEX22C9J3V5 150 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A096LPF7 62 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 NPSP0C0P6 89 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXI2Q6ZQN5 318 aa13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms