RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 PTPRGP23470 1445 aa0.38□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 NINQ8N4C6 2090 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 FASNP49327 2511 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRK2Q5S007 2527 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 MUC2Q02817 5179 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 TRANK1O15050 2925 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 TCRAP04437 139 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 SCTP09683 121 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 DR1Q01658 176 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 OR8B8Q15620 311 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 OTOSQ8NHW6 89 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 SMR3AQ99954 134 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 KCPQ6ZWJ8 1503 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 CREBBPQ92793 2442 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 EPG5Q9HCE0 2579 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 TRPM7Q96QT4 1865 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM189A5PLL7 270 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 DEGS1O15121 323 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 EDF1O60869 148 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 DPM2O94777 84 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 PRH1P02810 166 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 EVI2AP22794 236 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 SDC4P31431 198 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 OR8I2Q8N0Y5 310 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 OR8J3Q8NGG0 315 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 SMIM7Q9BQ49 75 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 COMMD3Q9UBI1 195 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 NAV3Q8IVL0 2385 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 ACACBO00763 2458 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 HECTD1Q9ULT8 2610 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 VWFP04275 2813 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 CACNA1EQ15878 2313 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 KIAA1109Q2LD37 5005 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 HIGD1CA8MV81 97 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 CDC42EP2O14613 210 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 TNFSF15O95150 251 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 CKS2P33552 79 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 PSPHP78330 225 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 FXYD3Q14802 87 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 RHOHQ15669 191 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 GLYATL3Q5SZD4 288 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 LYPD5Q6UWN5 251 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 SPINK6Q6UWN8 80 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 C5orf56Q8N8D9 126 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 OR4S1Q8NGB4 309 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 SPANXA1Q9NS26 97 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 SPANXCQ9NY87 97 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 BDP1A6H8Y1 2624 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 WDFY4Q6ZS81 3184 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 ABCA12Q86UK0 2595 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 CHD6Q8TD26 2715 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 LRP5O75197 1615 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 COL6A5A8TX70 2615 aa0.34□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.34□□□□□ -2.35
SNORD3E-201ENST00000362899 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A1B0GW64 132 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 C9JAW5 83 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 MT-ND4LP03901 98 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 SCGB1A1P11684 91 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 KDM5CP41229 1560 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 HSD17B12Q53GQ0 312 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM91Q6ZNR0 172 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 IDO2Q6ZQW0 420 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 AKAP14Q86UN6 197 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 DMAC1Q96GE9 116 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC00208Q96KT6 92 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 HIGD1AQ9Y241 93 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 KNTC1P50748 2209 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 RYR3Q15413 4870 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 ABCA13Q86UQ4 5058 aa0.33□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 ITPR3Q14573 2671 aa0.33□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 BCORL1Q5H9F3 1711 aa0.33□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa0.33□□□□□ -2.36
SNORD3E-201ENST00000362899 TENM4Q6N022 2769 aa0.33□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms