RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-170P-201ENST00000362832 MSMO1Q15800 293 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-170P-201ENST00000362832 DEFB135Q30KP9 77 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-170P-201ENST00000362832 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-170P-201ENST00000362832 BORCS7Q96B45 105 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-170P-201ENST00000362832 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM4Q9C037 500 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-170P-201ENST00000362832 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHMP5Q9NZZ3 219 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 I3L2K1 104 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 FABP4P15090 132 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 FADDQ13158 208 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 MED21Q13503 144 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 FKBP1CQ5VVH2 108 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 OTUD6BQ8N6M0 293 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIKE1Q9BRV8 207 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 PARVBQ9HBI1 364 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 VPS29Q9UBQ0 182 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 C9orf84Q5VXU9 1444 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 LAMA3Q16787 3333 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A087WUJ7 227 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2H2O95918 312 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 TFF1P04155 84 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERP29P30040 261 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 NDUFA6P56556 154 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 DEFB112Q30KQ8 113 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 C4orf33Q8N1A6 199 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 MPC1Q9Y5U8 109 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLXNA2O75051 1894 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNHD1Q96M86 4753 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSC2P49815 1807 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 LYSTQ99698 3801 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 M0R2P5 195 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDE6DO43924 150 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFNA7P01567 189 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 APOC1P02654 83 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERPINA6P08185 405 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 COX6B1P14854 86 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCL3L1P16619 93 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 HBBP68871 147 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFT20Q8IY31 132 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLEC2BQ92478 149 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2H1Q9GZK4 316 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 RTL9Q8NET4 1388 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLXNB2O15031 1838 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIF1BO60333 1816 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 DEGS1O15121 323 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPFFO15130 113 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 MFSD11O43934 449 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 MT-ND6P03923 174 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 CALB1P05937 261 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 OCM2P0CE71 109 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC48A1Q6P1K1 146 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 DIRC1Q969H9 104 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTH2Q96A98 100 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 SDF2Q99470 211 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC00472Q9H8W2 130 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAF9BQ9HBM6 251 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 V9GYV3 84 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 USP54Q70EL1 1684 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1B0GW64 132 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLDN24A6NM45 220 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 IQCF5A8MTL0 148 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 DEXIO95424 95 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRGC2P03986 189 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 HADHBP55084 474 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLDN22Q8N7P3 220 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR4S1Q8NGB4 309 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 COX7B2Q8TF08 81 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARAP1Q96P48 1450 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIK3C2GO75747 1445 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 AKAP13Q12802 2813 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM210A6NLX4 147 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 C5orf58C9J3I9 102 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFNA5P01569 189 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 S100A9P06702 114 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPL35P42766 123 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms