RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 OR2G3Q8NGZ4 309 aa10.38□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 CMTM2Q8TAZ6 248 aa10.38□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 SGK494Q96LW2 274 aa10.38□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 C11orf21Q9P2W6 132 aa10.38□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 TRGV11A0A075B6L2 103 aa10.37□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 TYMSP04818 313 aa10.37□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 STAG3L2P0CL84 134 aa10.37□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 STAG3L3P0CL85 134 aa10.37□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 NEGR1Q7Z3B1 354 aa10.37□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa10.37□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 RAB24Q969Q5 203 aa10.37□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 AQP10Q96PS8 301 aa10.37□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 TREM1Q9NP99 234 aa10.37□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 NAGKQ9UJ70 344 aa10.37□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 TRAV21A0A0B4J279 112 aa10.36□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa10.36□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 M0R2P5 195 aa10.36□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 IGLV2-11P01706 119 aa10.36□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 GYPEP15421 78 aa10.36□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 ATP6V0CP27449 155 aa10.36□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10.36□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 FAM74A1Q5RGS3 127 aa10.36□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 OR2T35Q8NGX2 323 aa10.36□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 TRAV4A0A0B4J268 109 aa10.35□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 GCHFRP30047 84 aa10.35□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 WFDC10BQ8IUB3 73 aa10.35□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 SH3BGRL3Q9H299 93 aa10.35□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 GGTLC3B5MD39 225 aa10.34□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 TCRAP04437 139 aa10.34□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 DPPA3Q6W0C5 159 aa10.34□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa10.34□□□□□ -0.75
CTSW-201ENST00000307886 SERF2P84101 59 aa10.33□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 C5orf17Q8NAS9 161 aa10.33□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 OR4C5Q8NGB2 326 aa10.33□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 RNF222A6NCQ9 220 aa10.33□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 HMSDA8MTL9 139 aa10.33□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 ORM1P02763 201 aa10.33□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 SRIP30626 198 aa10.33□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 ZNF726P1Q15940 193 aa10.33□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 Q8N1X5 172 aa10.33□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 SDF2L1Q9HCN8 221 aa10.33□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 EPDR1Q9UM22 224 aa10.33□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 PSG8Q9UQ74 426 aa10.33□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 DNAH10OSP0CZ25 163 aa10.32□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 C9orf62Q8N4C0 152 aa10.32□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 TMEM75Q8N9X5 138 aa10.32□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 KCNS1Q96KK3 526 aa10.32□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 TNFSF18Q9UNG2 199 aa10.32□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 LY96Q9Y6Y9 160 aa10.32□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa10.31□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 PGPEP1LA6NFU8 196 aa10.31□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 G3V3Q6 166 aa10.31□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 SMLR1H3BR10 107 aa10.31□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 LINC00479Q96M42 142 aa10.31□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 C9orf85Q96MD7 179 aa10.31□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.31□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 C9JCJ5 164 aa10.3□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 RS1O15537 224 aa10.3□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 CXorf1O96002 111 aa10.3□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 GCGP01275 180 aa10.3□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 MBP02144 154 aa10.3□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 ZNF876PQ49A33 203 aa10.3□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.3□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 SLC25A29Q8N8R3 303 aa10.3□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 OR11H4Q8NGC9 324 aa10.3□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 TXNDC17Q9BRA2 123 aa10.3□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 A0A087WTM6 91 aa10.29□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 TAAR5O14804 337 aa10.29□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 PFN1P07737 140 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 TIRAPP58753 221 aa10.29□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 PRNTQ86SH4 94 aa10.29□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 SCRT2Q9NQ03 307 aa10.29□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 TMEM167BQ9NRX6 74 aa10.29□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 MSRB1Q9NZV6 116 aa10.29□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa10.28□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 TRAV34A0A0B4J273 112 aa10.28□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa10.28□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 XGP55808 180 aa10.28□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 NDUFA5Q16718 116 aa10.28□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 NFE4Q86UQ8 179 aa10.28□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa10.28□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 PTH2Q96A98 100 aa10.28□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.28□□□□□ -0.76
CTSW-201ENST00000307886 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa10.27□□□□□ -0.77
CTSW-201ENST00000307886 A0A1W2PRE2 83 aa10.27□□□□□ -0.77
CTSW-201ENST00000307886 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CTSW-201ENST00000307886 K7EP13 123 aa10.27□□□□□ -0.77
CTSW-201ENST00000307886 ERVFC1-1P60608 527 aa10.27□□□□□ -0.77
CTSW-201ENST00000307886 IFITM2Q01629 132 aa10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms