RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 L7N2F9 121 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 VAMP2P63027 116 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 DEDD2Q8WXF8 326 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 DPH3Q96FX2 82 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087WX48 190 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 DIRC3C9JPN6 131 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNKO75909 580 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 SCGB1D2O95969 90 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 MT1HL1P0DM35 61 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF876PQ49A33 203 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6AWC8 147 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 MGST2Q99735 147 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.12□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 CRPP02741 224 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM18P0DKX4 95 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 INPP1P49441 399 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 BCAP31P51572 246 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 BAXQ07812 192 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR9Q5T870 116 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 MIC13Q5XKP0 118 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 TOMM5Q8N4H5 51 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 C7orf33Q8WU49 177 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2WQ96B02 151 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 SOSTQ9BQB4 213 aa5.11□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 A6NJY4 79 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFB4O95168 129 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 GAS8-AS1O95177 125 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 HBG1P69891 147 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 HBG2P69892 147 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL19P84098 196 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R1AQ13522 171 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 ODF1Q14990 250 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8TAT8 98 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 TMED6Q8WW62 240 aa5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 PYYP10082 97 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 S100A11P31949 105 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 CAV2P51636 162 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 PKIAP61925 76 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 STX12Q86Y82 276 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 ASB13Q8WXK3 278 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 MIXL1Q9H2W2 232 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 KLK12Q9UKR0 248 aa5.09□□□□□ -1.59
PGGT1B-201ENST00000296642 A8MWV9 139 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 CTDSP2O14595 271 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 TAAR5O14804 337 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6V1FQ16864 119 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 REG3GQ6UW15 175 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZQT7 251 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 NIT1Q86X76 327 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF185Q96GF1 192 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR83OSQ9Y284 106 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf170A2RU37 121 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 C7orf66A4D0T2 115 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 GAGE12JA6NER3 117 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 GNRH2O43555 120 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6V1G2O95670 118 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 TYMSP04818 313 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 RANP62826 216 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 GAGE1Q13065 139 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 GAGE4Q13068 117 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 GAGE5Q13069 117 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 GAGE13Q4V321 117 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 ATRAIDQ6UW56 229 aa5.07□□□□□ -1.6
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