RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 NKAPP1Q8N9T2 125 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 GP9P14770 177 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 Q8N9W7 124 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 F6UB75 175 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 IGKV1-17P01599 117 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 PFN2P35080 140 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 Q6ZWC4 215 aa14.82□□□□□ -0.04
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PTPRE-201ENST00000254667 TMEM89A2RUT3 159 aa14.81□□□□□ -0.04
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PTPRE-201ENST00000254667 CFHR4Q92496 578 aa14.81□□□□□ -0.04
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PTPRE-201ENST00000254667 C9JAW5 83 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 IGLV1-47P01700 117 aa14.81□□□□□ -0.04
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PTPRE-201ENST00000254667 IGLC3P0DOY3 106 aa14.8□□□□□ -0.04
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PTPRE-201ENST00000254667 COX11Q9Y6N1 276 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 GNRH2O43555 120 aa14.8□□□□□ -0.04
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PTPRE-201ENST00000254667 C16orf54Q6UWD8 224 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 LTBP2Q14767 1821 aa14.8□□□□□ -0.04
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PTPRE-201ENST00000254667 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
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PTPRE-201ENST00000254667 INAFM2P0DMQ5 153 aa14.79□□□□□ -0.04
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PTPRE-201ENST00000254667 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 SLURP1P55000 103 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRE-201ENST00000254667 K7EMT4 169 aa14.78□□□□□ -0.04
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PTPRE-201ENST00000254667 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
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PTPRE-201ENST00000254667 MYCNOSP40205 109 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRE-201ENST00000254667 SPINK8P0C7L1 97 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRE-201ENST00000254667 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRE-201ENST00000254667 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRE-201ENST00000254667 A0A087WW49 117 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRE-201ENST00000254667 MED13LQ71F56 2210 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRE-201ENST00000254667 CEND1Q8N111 149 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRE-201ENST00000254667 PIFOQ8TCI5 191 aa14.7□□□□□ -0.06
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