RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa15.03■□□□□ -0
PTPRJ-207ENST00000613246 E9PQ18 207 aa15.03■□□□□ -0
PTPRJ-207ENST00000613246 K7EP34 96 aa15.03■□□□□ -0
PTPRJ-207ENST00000613246 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PTPRJ-207ENST00000613246 HS3ST6Q96QI5 342 aa15.03■□□□□ -0
PTPRJ-207ENST00000613246 IGLC2P0DOY2 106 aa15.03■□□□□ -0
PTPRJ-207ENST00000613246 IGLC3P0DOY3 106 aa15.03■□□□□ -0
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PTPRJ-207ENST00000613246 LINC01619G3V211 115 aa15.02■□□□□ -0
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A087WV48 116 aa15.02■□□□□ -0
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1B0GX51 115 aa15.02■□□□□ -0
PTPRJ-207ENST00000613246 OVOL3O00110 214 aa15.02■□□□□ -0
PTPRJ-207ENST00000613246 OOSP1A8MZH6 123 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 NPSP0C0P6 89 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1B0GUS0 222 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 SDHAF1A6NFY7 115 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 COX8AP10176 69 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF183Q96D59 192 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF503Q96F45 646 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF5Q99942 180 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 LINC00205P59089 165 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 SPTSSBQ8NFR3 76 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 PFN1P07737 140 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 CD177Q8N6Q3 437 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 COL18A1P39060 1754 aa15□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 SRRM5B3KS81 715 aa15□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 EFNA2O43921 213 aa15□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 LINC00114Q6XXX2 140 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 CDKN1BP46527 198 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 COX7B2Q8TF08 81 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 LINC00473A8K010 186 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 MLANAQ16655 118 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 ACYP1P07311 99 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 MUSTN1Q8IVN3 82 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 PSMB8P28062 276 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 F8VRH5 84 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 C8orf86Q6ZUL3 223 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 C18orf32Q8TCD1 76 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 C15orf62A8K5M9 175 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 J3QQQ9 107 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 Q0VG73 95 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 PKIGQ9Y2B9 76 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 IGKV1-16P04430 117 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 FNDC10F2Z333 226 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF134P52741 427 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 Q6ZQT7 251 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 SPG11Q96JI7 2443 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A0G2JNJ9 132 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 Q9UFV3 132 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRJ-207ENST00000613246 LY6HO94772 140 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF883P0CG24 379 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 MST1LQ2TV78 715 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 Q71RC1 249 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 GNLYP22749 145 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 AMTNQ6UX39 209 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 PINLYPA6NC86 204 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 IGKV1D-12P01611 117 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 EPOPA6NHQ4 379 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 NREPQ16612 68 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 TIRAPP58753 221 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 GAFA1Q96PS6 74 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF223E7ERA6 249 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 NDUFB8O95169 186 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP6V0E1O15342 81 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 C12orf74Q32Q52 190 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 HIGD2BQ4VC39 106 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRJ-207ENST00000613246 SMIM20Q8N5G0 67 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms