RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 A0A087X0K7 114 aa15.93■□□□□ 0.14
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CTDP1-208ENST00000613122 NRGNQ92686 78 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDP1-208ENST00000613122 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
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CTDP1-208ENST00000613122 IGLV2-23P01705 113 aa15.84■□□□□ 0.13
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CTDP1-208ENST00000613122 SMIM2Q9BVW6 85 aa15.84■□□□□ 0.13
CTDP1-208ENST00000613122 PCP4P48539 62 aa15.83■□□□□ 0.13
CTDP1-208ENST00000613122 C17orf77Q96MU5 243 aa15.83■□□□□ 0.13
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CTDP1-208ENST00000613122 RNF138Q8WVD3 245 aa15.83■□□□□ 0.12
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CTDP1-208ENST00000613122 MYLKQ15746 1914 aa15.83■□□□□ 0.12
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CTDP1-208ENST00000613122 NOTCH4Q99466 2003 aa15.82■□□□□ 0.12
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CTDP1-208ENST00000613122 C20orf78Q9BR46 151 aa15.81■□□□□ 0.12
CTDP1-208ENST00000613122 C16orf74Q96GX8 76 aa15.81■□□□□ 0.12
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CTDP1-208ENST00000613122 Q6ZQT7 251 aa15.81■□□□□ 0.12
CTDP1-208ENST00000613122 PLA2G5P39877 138 aa15.8■□□□□ 0.12
CTDP1-208ENST00000613122 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CTDP1-208ENST00000613122 LENEPQ9Y5L5 61 aa15.8■□□□□ 0.12
CTDP1-208ENST00000613122 H3BMM0 161 aa15.8■□□□□ 0.12
CTDP1-208ENST00000613122 SCRT2Q9NQ03 307 aa15.8■□□□□ 0.12
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