RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584997.1

CASC3-210, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

TSL 3

Gene CASC3, Length 543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-210ENST00000584997 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC3-210ENST00000584997 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC3-210ENST00000584997 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.22□□□□□ -1.25
CASC3-210ENST00000584997 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 A0A1W2PPQ1 181 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 H7BYZ3 331 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 M6PRP20645 277 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 S100A1P23297 94 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 ICAM4Q14773 271 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 RAB24Q969Q5 203 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 ZNF503Q96F45 646 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 FAM210AQ96ND0 272 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 UPK3BQ9BT76 320 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.21□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.2□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 HYPMO75409 117 aa7.2□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 OR5G3P0C626 314 aa7.2□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 PSG3Q16557 428 aa7.2□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 GUK1Q16774 197 aa7.2□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 S100A7AQ86SG5 101 aa7.2□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.2□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.2□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 A0A087X0K7 114 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 GAGE12BA1L429 117 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 TMEM218A2RU14 115 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 SNURFLB1AK76 121 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 SCO1O75880 301 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 GAGE7O76087 117 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 GAGE12FP0CL80 117 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 GAGE12GP0CL81 117 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 GAGE12IP0CL82 117 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 STAG3L2P0CL84 134 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 STAG3L3P0CL85 134 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 ESRGQ1W209 222 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 EREGO14944 169 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 HOXA5P20719 270 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 LINC00315P59091 139 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 UQCC3Q6UW78 93 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 TREM1Q9NP99 234 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 GNG13Q9P2W3 67 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 RNF24Q9Y225 148 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 H3BNG1 76 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 MBP02144 154 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 SFTA3P0C7M3 94 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 BCL2P10415 239 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 PLP1P60201 277 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 SELENOTP62341 195 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 KIR3DS1Q14943 382 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 FUT9Q9Y231 359 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 J3KRW8 73 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 GCHFRP30047 84 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 PPT1P50897 306 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 ERVFC1-1P60608 527 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 FRZBQ92765 325 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.16□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 A0A096LPF7 62 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 SIVA1O15304 175 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 PAGE4O60829 102 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 PYYP10082 97 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 UBE2G2P60604 165 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 RAB31Q13636 194 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 Q5VSD8 79 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CASC3-210ENST00000584997 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC3-210ENST00000584997 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC3-210ENST00000584997 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.3 ms