RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 RNF182Q8N6D2 247 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF738Q8NE65 137 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 MGST2Q99735 147 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf94C9JXX5 98 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 TCAPO15273 167 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 GZMBP10144 247 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 FABP4P15090 132 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 ATP6V1FQ16864 119 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 MIC13Q5XKP0 118 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM189A5PLL7 270 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM9A6NGZ8 99 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 SPART-AS1P0CW21 52 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 SERF2P84101 59 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 PSG3Q16557 428 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 SPINK13Q1W4C9 94 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZTC4 211 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF664Q8N3J9 261 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF709Q8N972 641 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM37Q8WXS4 190 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 C17orf77Q96MU5 243 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 ATP5SQ99766 215 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 WDR83OSQ9Y284 106 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 RFNGQ9Y644 331 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 KMT2AQ03164 3969 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087X0K7 114 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 H3BTX0 84 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 M0R2Z0 102 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 IFNA1P01562 189 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 AMBPP02760 352 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 TYMSP04818 313 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 BCL2P10415 239 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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PTPRM-214ENST00000583153 LCN15Q6UWW0 184 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 BTF3L4Q96K17 158 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 IMMP2LQ96T52 175 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 NAT8Q9UHE5 227 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 CELA1Q9UNI1 258 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 IFNA5P01569 189 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 HTN1P15515 57 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 TCTAP57738 103 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 ERVFC1-1P60608 527 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 GAGE1Q13065 139 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 VWC2Q2TAL6 325 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 C12orf74Q32Q52 190 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 MORN5Q5VZ52 161 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 LINC01587Q99440 93 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 PRO1933Q9H354 126 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM250H0YL14 139 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 M0R143 59 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 MPDU1O75352 247 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-214ENST00000583153 INSP01308 110 aa5.97□□□□□ -1.45
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