RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRIM63Q969Q1 353 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 SPXQ9BT56 116 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 SRRQ9GZT4 340 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 AGPAT2O15120 278 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF253O75346 499 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 S100A5P33763 92 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF546Q86UE3 836 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 PSENENQ9NZ42 101 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.72□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.72□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 FNDC10F2Z333 226 aa6.72□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 NDUFB4O95168 129 aa6.72□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.72□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF492Q9P255 531 aa6.72□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.72□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.72□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRELID1Q9Y255 219 aa6.72□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 COX11Q9Y6N1 276 aa6.72□□□□□ -1.33
CTDNEP1-202ENST00000570380 A6NHS1 94 aa6.71□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 HOXB5P09067 269 aa6.71□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.71□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 ID3Q02535 119 aa6.71□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.71□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.71□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.71□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.71□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 MGST2Q99735 147 aa6.71□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.71□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 MCUBQ9NWR8 336 aa6.71□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 GGTLC3B5MD39 225 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 BAK1Q16611 211 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 TOR2AQ5JU69 321 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q8TAT8 98 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 PANO1I0J062 215 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 M0R2P5 195 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 SSSCA1O60232 199 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARL16Q0P5N6 197 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF266Q14584 549 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 VWC2Q2TAL6 325 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 RMI2Q96E14 147 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 SMIM8Q96KF7 97 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 LINC01600Q96MT4 127 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 GNRH2O43555 120 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF138P52744 262 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 RHOHQ15669 191 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.68□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A0D9SG52 128 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 SFT2D2O95562 160 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 PYYP10082 97 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 IL7P13232 177 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 BTCP35070 178 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 AP3S2P59780 193 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 PDE6HQ13956 83 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 MIC13Q5XKP0 118 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRIQKQ629K1 86 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q6AWC8 147 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q6ZRG5 221 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.67□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 CAMLGP49069 296 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 PPP1R1AQ13522 171 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 PFDN5Q99471 154 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 GGACTQ9BVM4 153 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 NAGKQ9UJ70 344 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 MUC2Q02817 5179 aa6.66□□□□□ -1.34
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.66□□□□□ -1.34
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