RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568494.1

ZNRF1-208, Transcript of zinc and ring finger 1, human

TSL 2

Gene ZNRF1, Length 2,046 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNRF1-208	ENST00000568494	BORCS7	Q96B45	105 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	RBAKDN	A6NC62	111 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	C3orf79	P0CE67	100 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	NTF3	P20783	257 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494		A0A1B0GUT8	65 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	PSMB8	P28062	276 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	C16orf92	Q96LL3	132 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	TPPP3	Q9BW30	176 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	CUBN	O60494	3623 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	CTRL	P40313	264 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	RIG	Q13278	110 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	TM4SF20	Q53R12	229 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	C20orf173	Q96LM9	149 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	HSBP1	O75506	76 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	BMI1	P35226	326 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	SPATA45	Q537H7	98 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	GPHB5	Q86YW7	130 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	HIVEP2	P31629	2446 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF575	Q86XF7	245 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	LY6G6D	O95868	133 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494		Q6AWC8	147 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF702P	Q9H963	129 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	TMEM89	A2RUT3	159 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494		M0R2Z0	102 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	CD5L	O43866	347 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	EDN2	P20800	178 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	SOCS3	O14543	225 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF138	P52744	262 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	GATD1	Q8NB37	220 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	ORM1	P02763	201 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	PMCHL1	Q16048	86 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	MUC21	Q5SSG8	566 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494	SMPX	Q9UHP9	88 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNRF1-208	ENST00000568494		A0A1B0GW15	77 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	TMEM213	A2RRL7	107 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGLC3	P0DOY3	106 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	DUX5	Q96PT3	197 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	NF1	P21359	2839 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494		K7EMT4	169 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	G0S2	P27469	103 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494		M0QZ24	198 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGLC6	P0CF74	106 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	DEFB1	P60022	68 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	SRD5A1	P18405	259 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	FOXE3	Q13461	319 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	BATF	Q16520	125 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	LINC01559	Q495D7	138 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	C2orf70	A6NJV1	201 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	ELANE	P08246	267 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494		Q6ZN92	141 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494		Q6ZQT7	251 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	ATOH7	Q8N100	152 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	C20orf202	A1L168	122 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	OVOL1	O14753	267 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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