RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 C16orf74Q96GX8 76 aa10.23□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.23□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 TXNDC17Q9BRA2 123 aa10.23□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 TRBV19A0A075B6N1 114 aa10.22□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 PLAC8L1A1L4L8 177 aa10.22□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 H7BYZ3 331 aa10.22□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 DEFB130BP0DP73 79 aa10.22□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 DEFB130AP0DP74 79 aa10.22□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 TAS2R45P59539 299 aa10.22□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM88Q6PEY1 159 aa10.22□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa10.22□□□□□ -0.77
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CMTM3-215ENST00000568477 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa10.22□□□□□ -0.77
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CMTM3-215ENST00000568477 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 ARL14EPLP0DKL9 152 aa10.21□□□□□ -0.77
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CMTM3-215ENST00000568477 GFI1BQ5VTD9 330 aa10.21□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 PQLC2Q6ZP29 291 aa10.21□□□□□ -0.77
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF493Q6ZR52 646 aa10.21□□□□□ -0.77
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CMTM3-215ENST00000568477 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.21□□□□□ -0.77
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CMTM3-215ENST00000568477 CT45A10P0DMU9 189 aa10.2□□□□□ -0.78
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CMTM3-215ENST00000568477 IQCF2Q8IXL9 164 aa10.2□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 C15orf53Q8NAA6 179 aa10.2□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
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CMTM3-215ENST00000568477 J3KRW8 73 aa10.19□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 M0R3E3 92 aa10.19□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 PAGE4O60829 102 aa10.19□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 SCO1O75880 301 aa10.19□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 NDUFB4O95168 129 aa10.19□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 ATP5G1P05496 136 aa10.19□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 ATP5G3P48201 142 aa10.19□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa10.19□□□□□ -0.78
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CMTM3-215ENST00000568477 BLNKQ8WV28 456 aa10.19□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 SLC25A2Q9BXI2 301 aa10.19□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 AAMDCQ9H7C9 122 aa10.19□□□□□ -0.78
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CMTM3-215ENST00000568477 FAM74A3Q4VXF1 159 aa10.18□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa10.18□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa10.17□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 NBEAP1P0C6P0 100 aa10.17□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 ERCC8Q13216 396 aa10.17□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00336Q6ZUF6 198 aa10.17□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa10.17□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 OR51M1Q9H341 326 aa10.17□□□□□ -0.78
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CMTM3-215ENST00000568477 M0R2N4 97 aa10.16□□□□□ -0.78
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CMTM3-215ENST00000568477 BTN1A1Q13410 526 aa10.16□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 RHEBQ15382 184 aa10.16□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 LGALS9BQ3B8N2 356 aa10.16□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 TVP23CQ96ET8 276 aa10.16□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF503Q96F45 646 aa10.16□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00477Q96M19 166 aa10.16□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10.16□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 PAXXQ9BUH6 204 aa10.16□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa10.16□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa10.15□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 FAM74A7A6NL05 159 aa10.15□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 SNURFLB1AK76 121 aa10.15□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 OR7C2O60412 319 aa10.15□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 OR10J4P0C629 311 aa10.15□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 CEBPGP53567 150 aa10.15□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 CST9LP1Q5W188 147 aa10.15□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 ATG101Q9BSB4 218 aa10.15□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.15□□□□□ -0.78
CMTM3-215ENST00000568477 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1W2PRE2 83 aa10.14□□□□□ -0.79
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF727A8MUV8 499 aa10.14□□□□□ -0.79
CMTM3-215ENST00000568477 KLLNB2CW77 178 aa10.14□□□□□ -0.79
CMTM3-215ENST00000568477 M0R036 132 aa10.14□□□□□ -0.79
CMTM3-215ENST00000568477 NUDT3O95989 172 aa10.14□□□□□ -0.79
CMTM3-215ENST00000568477 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CMTM3-215ENST00000568477 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CMTM3-215ENST00000568477 UBE2G2P60604 165 aa10.14□□□□□ -0.79
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.14□□□□□ -0.79
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