RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561204.5

MEIS3-211, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEIS3, Length 2,195 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-211ENST00000561204 FGF6P10767 208 aa13.31□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 Q6ZQT7 251 aa13.31□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 FAM223AQ8IWN6 122 aa13.31□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 DEFB125Q8N687 156 aa13.31□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 VPS13CQ709C8 3753 aa13.31□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 TNFRSF6BO95407 300 aa13.3□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 TRGV3P03979 118 aa13.3□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.3□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 HIF1ANQ9NWT6 349 aa13.3□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 TRAV40A0A0B4J280 105 aa13.3□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa13.3□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 EVI2AP22794 236 aa13.3□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 GLMPQ8WWB7 406 aa13.3□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 ATP6V0BQ99437 205 aa13.3□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa13.29□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 WFDC3Q8IUB2 231 aa13.29□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 TRBV12-3P01733 135 aa13.28□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 ARL3P36405 182 aa13.28□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 C20orf173Q96LM9 149 aa13.28□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa13.28□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 ERASQ7Z444 233 aa13.28□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 OR1N2Q8NGR9 330 aa13.28□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 C16orf92Q96LL3 132 aa13.28□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa13.28□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 LEPP41159 167 aa13.27□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 C18orf15Q96N68 181 aa13.27□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 MEGF9Q9H1U4 602 aa13.27□□□□□ -0.28
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa13.27□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 PRR9Q5T870 116 aa13.27□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 DKK2Q9UBU2 259 aa13.27□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 FCER1GP30273 86 aa13.26□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 TCTAP57738 103 aa13.26□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 GPHB5Q86YW7 130 aa13.26□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 PIMREGQ9BSJ6 248 aa13.26□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 IGF1P05019 195 aa13.25□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 BOD1L2Q8IYS8 172 aa13.25□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 LY6EQ16553 131 aa13.25□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 C9orf139Q6ZV77 190 aa13.25□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 C10orf105Q8TEF2 133 aa13.25□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa13.24□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 CD5LO43866 347 aa13.24□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 VAMP3Q15836 100 aa13.24□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa13.24□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 NDUFA4O00483 81 aa13.24□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 Q8N8P6 123 aa13.24□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 OR2K2Q8NGT1 345 aa13.24□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 CBY3A6NI87 242 aa13.23□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM97Q5BJF2 176 aa13.23□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 NRACQ8N912 160 aa13.23□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13.22□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 SOCS3O14543 225 aa13.22□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 CCL19Q99731 98 aa13.22□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 KLK15Q9H2R5 256 aa13.22□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 H3BUX3 64 aa13.22□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 IGHG2P01859 326 aa13.22□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM158Q8WZ71 300 aa13.22□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 UFC1Q9Y3C8 167 aa13.22□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.22□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 A6NDX4 124 aa13.21□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 H3BVH4 76 aa13.21□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV3-11P01762 117 aa13.21□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 DEFB1P60022 68 aa13.21□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 ODF1Q14990 250 aa13.21□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.21□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 PCP2Q8IVA1 136 aa13.21□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 ZMAT4Q9H898 229 aa13.21□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 COL12A1Q99715 3063 aa13.21□□□□□ -0.29
MEIS3-211ENST00000561204 J3KRW8 73 aa13.21□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 BRI3O95415 125 aa13.21□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 SPANXN1Q5VSR9 72 aa13.21□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 Q6ZS46 218 aa13.21□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa13.21□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 PRSS47A8MTI9 375 aa13.2□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 BLCAPP62952 87 aa13.2□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 OR4C5Q8NGB2 326 aa13.2□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 USMG5Q96IX5 58 aa13.2□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa13.2□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 NMUP48645 174 aa13.2□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 SEC11AP67812 179 aa13.2□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 LINC00477Q96M19 166 aa13.2□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 HHLA3Q9XRX5 114 aa13.2□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 A1L4Q6 167 aa13.19□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 H3BUA1 57 aa13.19□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 PRSS1P07477 247 aa13.19□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 LCNL1Q6ZST4 164 aa13.19□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 OR9G4Q8NGQ1 327 aa13.19□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 NDUFS8O00217 210 aa13.18□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa13.18□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa13.18□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 OR10J6PQ8NGY7 276 aa13.18□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 C7orf71A4D174 169 aa13.18□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 OVOL1O14753 267 aa13.18□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 SIVA1O15304 175 aa13.18□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 SMIM17P0DL12 118 aa13.18□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 PF4V1P10720 104 aa13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 868.2 ms