RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	DEFB1	P60022	68 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	HAGH	Q16775	308 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00477	Q96M19	166 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312		F6UZH7	168 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	PAGE4	O60829	102 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	IFNA1	P01562	189 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	TCRA	P04437	139 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	NMB	P08949	121 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	TSPO	P30536	169 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	UBE2G2	P60604	165 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	CST9LP1	Q5W188	147 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	AMTN	Q6UX39	209 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	ATG101	Q9BSB4	218 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	EPDR1	Q9UM22	224 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312		A0A1B0GV50	99 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV3-20	P01619	116 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	CDKN1B	P46527	198 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF138	P52744	262 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	CCL20	P78556	96 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	GNG13	Q9P2W3	67 aa		5.47	□□□□□ -1.53
NUMB-231	ENST00000559312	C11orf94	C9JXX5	98 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	PEX7	O00628	323 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	CT45A10	P0DMU9	189 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	BCL2	P10415	239 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	LEP	P41159	167 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	GNG5	P63218	68 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	C10orf25	Q5T742	122 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	RNF183	Q96D59	192 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	RCHY1	Q96PM5	261 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	VGLL1	Q99990	258 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF492	Q9P255	531 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	VAX2	Q9UIW0	290 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	COL7A1	Q02388	2944 aa		5.46	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	KLLN	B2CW77	178 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312		M0R2Z0	102 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	PDE6D	O43924	150 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	INS	P01308	110 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	CRISP2	P16562	243 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	ATP5G3	P48201	142 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	ERCC8	Q13216	396 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	DEFB135	Q30KP9	77 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	FMC1	Q96HJ9	113 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	ASCL2	Q99929	193 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV2-11	P01706	119 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	GPX1	P07203	203 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	RAB14	P61106	215 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312		Q8TAT8	98 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	C11orf52	Q96A22	123 aa		5.44	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms