RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557114.5

CCNB1IP1-215, Transcript of cyclin B1 interacting protein 1, human

TSL 5

Gene CCNB1IP1, Length 756 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		5	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	OR5G3	P0C626	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	M6PR	P20645	277 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ZNF90	Q03938	601 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		F5H768	121 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	NMB	P08949	121 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	DEFB1	P60022	68 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		Q6ZRG5	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PFDN5	Q99471	154 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TNXB	P22105	4242 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		H3BRN7	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PAGE4	O60829	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PRM2	P04554	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	CD5	P06127	495 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	RAB2A	P61019	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		Q8WTZ3	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	HELT	A6NFD8	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		H3BMM0	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	HYPM	O75409	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	IL4	P05112	153 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	S100A7	P31151	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ASIP	P42127	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	FHIT	P49789	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	RHOB	P62745	196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114		A0A087WTM6	91 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	NDUFB4	O95168	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	HBE1	P02100	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	CRYBB3	P26998	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	TAS2R45	P59539	299 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	RAB14	P61106	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	LYZ	P61626	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-215	ENST00000557114	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms