RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555503.1

GPHN-208, Transcript of gephyrin, human

TSL 3

Gene GPHN, Length 655 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-208	ENST00000555503	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	SYNGR2	O43760	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	MED6	O75586	246 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	IL5	P05113	134 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	LINC00869	P0C866	280 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	CXCL3	P19876	107 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	TAS2R60	P59551	318 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	PSG3	Q16557	428 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	GPR82	Q96P67	336 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPHN-208	ENST00000555503	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	SSSCA1	O60232	199 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	HYPM	O75409	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	ADAP1	O75689	374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	M6PR	P20645	277 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	CDKN1B	P46527	198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	B2M	P61769	119 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	ESRG	Q1W209	222 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503		Q9H3A6	140 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	SLC17A3	O00476	420 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	RLN2	P04090	185 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	LINC00315	P59091	139 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	MCFD2	Q8NI22	146 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503		H7BYZ3	331 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	SFT2D2	O95562	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	SLC25A6	P12236	298 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	S100A7	P31151	101 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503		Q6ZTI0	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503		A0A096LPF7	62 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	GOSR2	O14653	212 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	HAMP	P81172	84 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	LAGE3	Q14657	143 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	PARL	Q9H300	379 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GPHN-208	ENST00000555503	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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