RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 NEU1Q99519 415 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 CELA1Q9UNI1 258 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 PRELID1Q9Y255 219 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 INSP01308 110 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 AZU1P20160 251 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 SERF2P84101 59 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 RRN3P1Q2M238 152 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 HYLS1Q96M11 299 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 Q9H3A6 140 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 PGPA6NDG6 321 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 TAAR5O14804 337 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 TSPOP30536 169 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 C12orf74Q32Q52 190 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 Q6ZNX1 250 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 LINC00477Q96M19 166 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 VGLL1Q99990 258 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 HSPG2P98160 4391 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 TMEM189A5PLL7 270 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 HMSDA8MTL9 139 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 PAGE4O60829 102 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 MBP02144 154 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 STAG3L2P0CL84 134 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 STAG3L3P0CL85 134 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 LEPP41159 167 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 CSN1S1P47710 185 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 Q6ZTC4 211 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 SSX7Q7RTT5 188 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 PKD1P98161 4303 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 A0A0D9SG52 128 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GVY2 172 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 GCHFRP30047 84 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 CD300CQ08708 224 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 OTORQ9NRC9 128 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 DKK2Q9UBU2 259 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 IGLL5B9A064 214 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 DIRC3C9JPN6 131 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 F5H697 171 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 H7BYZ3 331 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 TRIAP1O43715 76 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 CXorf1O96002 111 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 GPX1P07203 203 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 TAS2R60P59551 318 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 BTN1A1Q13410 526 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 ZNF345Q14585 488 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 ZNF726P1Q15940 193 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 RNF151Q2KHN1 245 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 Q6ZQT7 251 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 Q8TAT8 98 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 ODF3Q96PU9 254 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 ZNF492Q9P255 531 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 C7orf71A4D174 169 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 C11orf94C9JXX5 98 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 ZNF138P52744 262 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 GNG5P63218 68 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 PRR9Q5T870 116 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 TMUB2Q71RG4 321 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 SGK494Q96LW2 274 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-217ENST00000550044 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.84□□□□□ -1.31
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