RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549306.1

HECTD4-210, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-210ENST00000549306 PAXXQ9BUH6 204 aa2.49□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 SAMD10Q9BYL1 202 aa2.49□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 PARP11Q9NR21 331 aa2.49□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 SPANXCQ9NY87 97 aa2.49□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 EHFQ9NZC4 300 aa2.49□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 KCNIP1Q9NZI2 227 aa2.49□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ZFHX4Q86UP3 3567 aa2.49□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ASPMQ8IZT6 3477 aa2.49□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ROS1P08922 2347 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 MEIS3P1A6NDR6 274 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 DPRXA6NFQ7 191 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 J3QQQ9 107 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 M0R1B8 84 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 CCL21O00585 134 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 CRXO43186 299 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 SFT2D2O95562 160 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 FSTL3O95633 263 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 GPX1P07203 203 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 FGF6P10767 208 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 SLC25A6P12236 298 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 CD99P14209 185 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 SNCAP37840 140 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 FABP6P51161 128 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 TPPP2P59282 170 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 RND3P61587 244 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 HLA-DRB3P79483 266 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 BSPH1Q075Z2 132 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 TFF3Q07654 80 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ELOBQ15370 118 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ACP7Q6ZNF0 438 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 TEX29Q8N6K0 151 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 GVQW1Q8N7I0 195 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 Q8N976 141 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 OR5H2Q8NGV7 314 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF502Q8TBZ5 544 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF286AQ9HBT8 521 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 RPRMQ9NS64 109 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 AK3Q9UIJ7 227 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ESPL1Q14674 2120 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ABCA4P78363 2273 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 PKDREJQ9NTG1 2253 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 MYO18BQ8IUG5 2567 aa2.48□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 A0A087WWC5 75 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 DEFB108AA8MXU0 73 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 GGTLC3B5MD39 225 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 OVOL1O14753 267 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF737O75373 536 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 LHBP01229 141 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 IGHV1-46P01743 117 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 SRP14P37108 136 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 APOC4P55056 127 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 HERVK_113P63121 156 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 MSMO1Q15800 293 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 FAM201AQ5SY85 155 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF695Q8IW36 515 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 SGPP2Q8IWX5 399 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ATOH7Q8N100 152 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 C3orf56Q8N813 242 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF709Q8N972 641 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ARPC1AQ92747 370 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 BORCS7Q96B45 105 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ACY3Q96HD9 319 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 GNB1LQ9BYB4 327 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 FXYD6Q9H0Q3 95 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM106BQ9NUM4 274 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 TAAR3PQ9P1P4 343 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 LRRK2Q5S007 2527 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF462Q96JM2 2506 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 CACNA1BQ00975 2339 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 NBEAQ8NFP9 2946 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 BSNQ9UPA5 3926 aa2.47□□□□□ -2.01
HECTD4-210ENST00000549306 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 FAM208BQ5VWN6 2430 aa2.46□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.46□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa2.46□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa2.46□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa2.46□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 A0A0U1RQV1 116 aa2.46□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa2.46□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa2.46□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa2.46□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 E7EQL1 145 aa2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms