RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.26□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.26□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TRGV3P03979 118 aa7.26□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.26□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.26□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.26□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF318Q5VUA4 2279 aa7.26□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 CEND1Q8N111 149 aa7.26□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 POLEQ07864 2286 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TPRP12270 2363 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 PRSS47A8MTI9 375 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 K7ERJ3 54 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 NRACQ8N912 160 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 METTL26Q96S19 204 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TM2D2Q9BX73 214 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF292O60281 2723 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 ATP6V0E1O15342 81 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 PLNP26678 52 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 ACACAQ13085 2346 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 CCL21O00585 134 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 KLK9Q2XQG4 91 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A087WX48 190 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TAL2Q16559 108 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC140Q96MF4 163 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TTC28Q96AY4 2481 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 K7ENP7 123 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TCF15Q12870 199 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 MRAP2Q96G30 205 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 SIRPDQ9H106 197 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 LRBAP50851 2863 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 UBE2E1P51965 193 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 H3BVH4 76 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 EFNA4P52798 201 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 C16orf92Q96LL3 132 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 HIST1H4GQ99525 98 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.21□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 E9PLD3 99 aa7.21□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 G3V318 75 aa7.21□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 H7C1H1 209 aa7.21□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.21□□□□□ -1.25
RRN3P1-202ENST00000546471 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 IGLL5B9A064 214 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM238C9JI98 176 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 F8VRH5 84 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF479Q96JC4 524 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.21□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 F8W1H4 67 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 SLC25A16P16260 332 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 SAA4P35542 130 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 ATP5G2Q06055 141 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 CDSNQ15517 529 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 U3KQE9 123 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 OR11H12B2RN74 326 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 FOXC1Q12948 553 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 C12orf74Q32Q52 190 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 OR11H1Q8NG94 326 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 OR11H2Q8NH07 326 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.2□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 K7EMI3 77 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 ADORA2A-AS1P86434 159 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 Q6ZQT7 251 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 AJUBAQ96IF1 538 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms