RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 Q8TAT8 98 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 ZNF503Q96F45 646 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 MED28Q9H204 178 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 WFDC1Q9HC57 220 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 ALG5Q9Y673 324 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-222ENST00000540445 DIRC3C9JPN6 131 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 H3BNG1 76 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 SPINK4O60575 86 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 TCL1AP56279 114 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 ESRGQ1W209 222 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 MUC21Q5SSG8 566 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 PRR9Q5T870 116 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 Q6ZQT7 251 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 IGHV3-53P01767 116 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 ZNF415Q09FC8 603 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 C6orf223Q8N319 242 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 OTORQ9NRC9 128 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 PAX4O43316 350 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 PTTG1O95997 202 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 RAB2AP61019 212 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 ZNF266Q14584 549 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 C18orf15Q96N68 181 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 MDFICQ9P1T7 246 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 NAGKQ9UJ70 344 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 A0A096LPF7 62 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 MED14OSP0DP75 135 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 TNP2Q05952 138 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 SLAQ13239 276 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 TREM1Q9NP99 234 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 PRO0255Q9UI72 69 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 GNRH2O43555 120 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 MBP02144 154 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 ATP6V0CP27449 155 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 GNG5P63218 68 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 TTC32Q5I0X7 151 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 Q6AWC8 147 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 TMED6Q8WW62 240 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 RAB24Q969Q5 203 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 SGK494Q96LW2 274 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 C8orf49Q96NF6 230 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 AQP10Q96PS8 301 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 SPXQ9BT56 116 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 F6UZH7 168 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 K7EQM0 130 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 SFTA3P0C7M3 94 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 STAG3L2P0CL84 134 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 STAG3L3P0CL85 134 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 CRYBA4P53673 196 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 SERF2P84101 59 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 FHL2Q14192 279 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 Q5BKY6 102 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 UPK3BQ9BT76 320 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
LMO3-222ENST00000540445 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-222ENST00000540445 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PPQ1 181 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-222ENST00000540445 C16orf90A8MZG2 172 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-222ENST00000540445 SIVA1O15304 175 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-222ENST00000540445 CXorf1O96002 111 aa6.21□□□□□ -1.42
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