RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 COX7A2P2O60397 106 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 OR4E1P0C645 316 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 SEC11BP0C7V7 166 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00869P0C866 280 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 CSN1S1P47710 185 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 TAS2R45P59539 299 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 CLINT1Q14677 625 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 TDRG1Q3Y452 100 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 SPANXN5Q5MJ07 72 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 CD164L2Q6UWJ8 174 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 LYZL2Q7Z4W2 148 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 Q8N377 158 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF709Q8N972 641 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF738Q8NE65 137 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 OR4B1Q8NGF8 309 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 LHFPL5Q8TAF8 219 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 CYYR1Q96J86 154 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00477Q96M19 166 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 MIXL1Q9H2W2 232 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 PSENENQ9NZ42 101 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM14CQ9P0S9 112 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 XCL2Q9UBD3 114 aa2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0G2JRQ6 117 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0U1RRA0 63 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 SMCO3A2RU48 225 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 K7EQM0 130 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 OR5G3P0C626 314 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 RBMY1CP0DJD4 496 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 ORM2P19652 201 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 M6PRP20645 277 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 TGFBR1P36897 503 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 RPL29P47914 159 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 SULT1A1P50225 295 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 DEFA1P59665 94 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 DEFA3P59666 94 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 RHOBP62745 196 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R1AQ13522 171 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 OR2F1Q13607 317 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 SPCS2Q15005 226 aa2.95□□□□□ -1.94
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HDAC2-216ENST00000523628 PSG3Q16557 428 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 SPINK9Q5DT21 86 aa2.95□□□□□ -1.94
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HDAC2-216ENST00000523628 FAM222AQ5U5X8 452 aa2.95□□□□□ -1.94
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HDAC2-216ENST00000523628 C10orf113Q5VZT2 155 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 C10orf126Q8N4M7 172 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 OR8A1Q8NGG7 326 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 UPK3BQ9BT76 320 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 RSG1Q9BU20 258 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 SRRQ9GZT4 340 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 ARV1Q9H2C2 271 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A22Q9H936 323 aa2.95□□□□□ -1.94
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HDAC2-216ENST00000523628 UQCC1Q9NVA1 299 aa2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 DNAH9Q9NYC9 4486 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFAF8A1L188 74 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 KNCNA6PVL3 124 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 SSSCA1O60232 199 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV3-48P01763 117 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 ORM1P02763 201 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 CXCL3P19876 107 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 CAMLGP49069 296 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF90Q03938 601 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF266Q14584 549 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 C12orf74Q32Q52 190 aa2.94□□□□□ -1.94
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HDAC2-216ENST00000523628 FAAP20Q6NZ36 180 aa2.94□□□□□ -1.94
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HDAC2-216ENST00000523628 OR11H7Q8NGC8 314 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 RXFP4Q8TDU9 374 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 C2orf50Q96LR7 162 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 ARL6Q9H0F7 186 aa2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
HDAC2-216ENST00000523628 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa2.94□□□□□ -1.94
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