RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 PRNTQ86SH4 94 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 CENPEQ02224 2701 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV1-16P04430 117 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 TCRAP04437 139 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 NPIPB3Q92617 1050 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 ZZEF1O43149 2961 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 CLEC3BP05452 202 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 SPRNQ5BIV9 151 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
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TRPS1-211ENST00000520276 PRCDQ00LT1 54 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 ODF1Q14990 250 aa7.91□□□□□ -1.14
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TRPS1-211ENST00000520276 FMC1Q96HJ9 113 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
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TRPS1-211ENST00000520276 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.91□□□□□ -1.14
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TRPS1-211ENST00000520276 ITPR1Q14643 2758 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 CT45A10P0DMU9 189 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 LOXL3P58215 753 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 Q86TA4 180 aa7.91□□□□□ -1.14
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TRPS1-211ENST00000520276 CD177Q8N6Q3 437 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 Q9H3A6 140 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 RIGQ13278 110 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf83Q53S99 150 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 CALYQ9NYX4 217 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPS1-211ENST00000520276 NPYP01303 97 aa7.9□□□□□ -1.15
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TRPS1-211ENST00000520276 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.9□□□□□ -1.15
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TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H4GQ99525 98 aa7.9□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 GAS8-AS1O95177 125 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 SRD5A1P18405 259 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 PRTN3P24158 256 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 RITA1Q96K30 269 aa7.89□□□□□ -1.15
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TRPS1-211ENST00000520276 PRSS1P07477 247 aa7.88□□□□□ -1.15
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TRPS1-211ENST00000520276 PSMB2P49721 201 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 CRIP1P50238 77 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 ORMDL3Q8N138 153 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM160Q9NX00 188 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 ATMQ13315 3056 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 J3QLI3 93 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 IGKCP01834 107 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 PIFOQ8TCI5 191 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 HARBI1Q96MB7 349 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 UPK2O00526 184 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 CITED1Q99966 193 aa7.88□□□□□ -1.15
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TRPS1-211ENST00000520276 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.87□□□□□ -1.15
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TRPS1-211ENST00000520276 LHBP01229 141 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 GAGE12FP0CL80 117 aa7.87□□□□□ -1.15
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TRPS1-211ENST00000520276 GAGE12IP0CL82 117 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 GP9P14770 177 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 GAGE4Q13068 117 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.87□□□□□ -1.15
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TRPS1-211ENST00000520276 U3KQK5 164 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.86□□□□□ -1.15
TRPS1-211ENST00000520276 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
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