RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 PAXXQ9BUH6 204 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 LINC01546A6NGU7 62 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 LINC01549A6NIU2 74 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 MFAP4P55083 255 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 LRBAP50851 2863 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 DPM2O94777 84 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 NDUFA7O95182 113 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 FSTL3O95633 263 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 NPYP01303 97 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 C15orf61A6NNL5 157 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 FCER1GP30273 86 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 LINC01559Q495D7 138 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 ORMDL3Q8N138 153 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF714Q96N38 554 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 ENY2Q9NPA8 101 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 C17orf100A8MU93 164 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 TWIST1Q15672 202 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 PRNDQ9UKY0 176 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 ATRXP46100 2492 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 TACC2O95359 2948 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 F5H768 121 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 NPIPB3Q92617 1050 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 CCL17Q92583 94 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 LINC01600Q96MT4 127 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 ABCA4P78363 2273 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF785A8K8V0 405 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 F8WDY8 70 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 OOSP1A8MZH6 123 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 K7ENP7 123 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 SLC25A20O43772 301 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 ATP5LO75964 103 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 IGKV1-16P04430 117 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 CCL3L1P16619 93 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM219Q86XT9 240 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 MRAPQ8TCY5 172 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 DUX5Q96PT3 197 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 PGPA6NDG6 321 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 H3BVH4 76 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 CD7P09564 240 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 ORM2P19652 201 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 HERVK_113P63121 156 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 TCRAP04437 139 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 IGLC6P0CF74 106 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 SFTA2Q6UW10 78 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 PATE2Q6UY27 113 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 Q86TA4 180 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 Q8N1Y9 231 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 SPANXCQ9NY87 97 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 PRSS1P07477 247 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 UCNP55089 124 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 HES1Q14469 280 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 AMN1Q8IY45 258 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 FOXC2Q99958 501 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM178BH3BS89 294 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM160Q9NX00 188 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-209ENST00000519674 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.59□□□□□ -1.36
TRPS1-209ENST00000519674 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.59□□□□□ -1.36
TRPS1-209ENST00000519674 COX7A2P2O60397 106 aa6.59□□□□□ -1.36
TRPS1-209ENST00000519674 IGLV2-11P01706 119 aa6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms