RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 DUX3Q96PT4 197 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 OTORQ9NRC9 128 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-210ENST00000512194 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 KRBOX1C9JBD0 128 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 TMEM250H0YL14 139 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 APOHP02749 345 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 IGLC2P0DOY2 106 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 S100A1P23297 94 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 CEBPGP53567 150 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 HIST1H2BAQ96A08 127 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 RARRES2Q99969 163 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 GPR61Q9BZJ8 451 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 Q9H3A6 140 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 NRN1Q9NPD7 142 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 ZNF586Q9NXT0 402 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 TMEM218A2RU14 115 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 F8W036 122 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 H3BQ15 152 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 ISLRO14498 428 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SAP30O75446 220 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 CSN3P07498 182 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 INSL3P51460 131 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP10-3P60369 221 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 MLXQ9UH92 298 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 OR4C46A6NHA9 309 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 H3BTX0 84 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 PEX7O00628 323 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SFTA3P0C7M3 94 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 AKR1C3P42330 323 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 UBE2G1P62253 170 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 LCN12Q6JVE5 192 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 LINC00052Q96N35 136 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 ATG101Q9BSB4 218 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 EPDR1Q9UM22 224 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 ZNF727A8MUV8 499 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 GGTLC3B5MD39 225 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 ATP5G3P48201 142 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 TAS2R60P59551 318 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 PSG3Q16557 428 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 ZNF738Q8NE65 137 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 C11orf52Q96A22 123 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 FMC1Q96HJ9 113 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SEC11CQ9BY50 192 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 BIN3Q9NQY0 253 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 RBAKDNA6NC62 111 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 TCRAP04437 139 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 TFPI2P48307 235 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 ERVFC1-1P60608 527 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 GUCA2BQ16661 112 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 TVP23CQ96ET8 276 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 NAT8Q9UHE5 227 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 K7EQG2 157 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC3-210ENST00000512194 SLC17A3O00476 420 aa5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms