RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 DUX5Q96PT3 197 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 Q5PR19 223 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZN92 141 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 J3QLI3 93 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 EREGO14944 169 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 FOXE3Q13461 319 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 MAJINQ3KP22 176 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 OR4C46A6NHA9 309 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 FXYD7P58549 80 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 Q8N976 141 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 C2orf70A6NJV1 201 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 F6UB75 175 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 C20orf173Q96LM9 149 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 OVOL1O14753 267 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 Q96MF0 132 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLC6P0CF74 106 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 CTRLP40313 264 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00477Q96M19 166 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV1-40P01703 118 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01559Q495D7 138 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 H3BVH4 76 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 EVI2AP22794 236 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 ID1P41134 155 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 SMPXQ9UHP9 88 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 SORL1Q92673 2214 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 NPYP01303 97 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZQT7 251 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-208ENST00000510829 M0R381 172 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 IGKV3-20P01619 116 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLC3P0DOY3 106 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 hDV102S1A0JD36 115 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 SPRY2O43597 315 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 EDN2P20800 178 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 SYNJ2BPP57105 145 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 TCF21O43680 179 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 PPBPP02775 128 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF688P0C7X2 276 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLL1P15814 213 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 PET117Q6UWS5 81 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 GATD1Q8NB37 220 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 BRI3O95415 125 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 PSMB8P28062 276 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 GPHB5Q86YW7 130 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 PRR9Q5T870 116 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 C18orf15Q96N68 181 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 TNFRSF6BO95407 300 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 ASIPP42127 132 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-208ENST00000510829 PSMG4Q5JS54 123 aa8.37□□□□□ -1.07
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