RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 H3BNG1 76 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP2-216ENST00000510193 ARPC5O15511 151 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP2-216ENST00000510193 OR7C2O60412 319 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP2-216ENST00000510193 MED14OSP0DP75 135 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP2-216ENST00000510193 ATP6V0CP27449 155 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF138P52744 262 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP2-216ENST00000510193 ESRGQ1W209 222 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP2-216ENST00000510193 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP2-216ENST00000510193 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP2-216ENST00000510193 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
SH3BP2-216ENST00000510193 C6orf223Q8N319 242 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP2-216ENST00000510193 Q9H3A6 140 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP2-216ENST00000510193 RYR1P21817 5038 aa8.77□□□□□ -1
SH3BP2-216ENST00000510193 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A096LPF7 62 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 GPX1P07203 203 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 RANP62826 216 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF266Q14584 549 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 UPK3BQ9BT76 320 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 RBAKDNA6NC62 111 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 Q9H8V8 135 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 DIRC3C9JPN6 131 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 RGS13O14921 159 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 KHDC3LQ587J8 217 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 HSPG2P98160 4391 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A1W2PPV4 95 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TAS2R45P59539 299 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 MUC21Q5SSG8 566 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 Q6AWC8 147 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 IGHV3-53P01767 116 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 Q6ZNX1 250 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TVP23CQ96ET8 276 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 MDFICQ9P1T7 246 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 MUC4Q99102 2169 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CSN1S1P47710 185 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF415Q09FC8 603 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 FHL2Q14192 279 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 TMED6Q8WW62 240 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 RAB24Q969Q5 203 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 OTORQ9NRC9 128 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 PGPA6NDG6 321 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 CRYBA4P53673 196 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 SERF2P84101 59 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 TTC32Q5I0X7 151 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 HYLS1Q96M11 299 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A1W2PPQ1 181 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 HMSDA8MTL9 139 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 TAAR5O14804 337 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 MBP02144 154 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 STAG3L2P0CL84 134 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 STAG3L3P0CL85 134 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 GNG5P63218 68 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 TDRG1Q3Y452 100 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.69□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 C16orf90A8MZG2 172 aa8.69□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 F6UZH7 168 aa8.69□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 PAX4O43316 350 aa8.69□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 SFTA3P0C7M3 94 aa8.69□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 GCHFRP30047 84 aa8.69□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF726P1Q15940 193 aa8.69□□□□□ -1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms