RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 GAGE12IP0CL82 117 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A0D9SG52 128 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF345Q14585 488 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM159AQ6UWV7 190 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 SUN5Q8TC36 379 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 TRGV2A0A075B6R0 118 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 OR5I1Q13606 314 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 PRR9Q5T870 116 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 TREM1Q9NP99 234 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 GNG5P63218 68 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 STOML3Q8TAV4 291 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1W2PRE2 83 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 NUDT3O95989 172 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 TCRAP04437 139 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF415Q09FC8 603 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 MUC21Q5SSG8 566 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 Q6AWC8 147 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 ATG101Q9BSB4 218 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 EPDR1Q9UM22 224 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 PFDN1O60925 122 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 IFNA7P01567 189 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 TCL1AP56279 114 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF212Q495C1 297 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 C11orf72Q8NBR9 251 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 TRGV11A0A075B6L2 103 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 TRAV21A0A0B4J279 112 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 Q6ZTI0 123 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 SSX7Q7RTT5 188 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 NAGKQ9UJ70 344 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-210ENST00000505941 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 BCL2L11O43521 198 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 PPT1P50897 306 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF726P1Q15940 193 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFP69Q49AA0 526 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 UMAD1C9J7I0 102 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 SPINK4O60575 86 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 SEC11BP0C7V7 166 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 UBE2G2P60604 165 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 Q6ZQT7 251 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 SGK494Q96LW2 274 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 PSG8Q9UQ74 426 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 GGTLC3B5MD39 225 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 CCL18P55774 89 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 PRNTQ86SH4 94 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNS1Q96KK3 526 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 F6UZH7 168 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 TMUB2Q71RG4 321 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 C18orf15Q96N68 181 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 SPXQ9BT56 116 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 SMUG1Q53HV7 270 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 TDRG1Q3Y452 100 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 TVP23CQ96ET8 276 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A0J9YY99 117 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM74A7A6NL05 159 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 HOXA5P20719 270 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SLAQ13239 276 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CST9LP1Q5W188 147 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 MDFICQ9P1T7 246 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-210ENST00000505941 H3BNG1 76 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms