RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLC6P0CF74 106 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 C16orf92Q96LL3 132 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 RCHY1Q96PM5 261 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.18□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
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SH3BP2-209ENST00000504450 CTRLP40313 264 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 IQCJQ1A5X6 159 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC01559Q495D7 138 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 REC114Q7Z4M0 266 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM213A2RRL7 107 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 LGALS9O00182 355 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 EDN2P20800 178 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6ZWC4 215 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNS1Q96KK3 526 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00477Q96M19 166 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 NRN1Q9NPD7 142 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.16□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.15□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.15□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.15□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 CNFNQ9BYD5 112 aa8.15□□□□□ -1.1
SH3BP2-209ENST00000504450 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 SRD5A1P18405 259 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR31Q5SQ13 230 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 NIT1Q86X76 327 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF738Q8NE65 137 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 U3KQK5 164 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 CUBNO60494 3623 aa8.14□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A087WW49 117 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 ORM1P02763 201 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.13□□□□□ -1.11
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SH3BP2-209ENST00000504450 BORCS7Q96B45 105 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF114Q9Y508 228 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 ZANQ9Y493 2812 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 COL6A5A8TX70 2615 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.12□□□□□ -1.11
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SH3BP2-209ENST00000504450 CD33P20138 364 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 AMTP48728 403 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR9Q5T870 116 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 Q8N976 141 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 NAGKQ9UJ70 344 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
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SH3BP2-209ENST00000504450 DEFB1P60022 68 aa8.11□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 PKIAP61925 76 aa8.11□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6ZSV7 163 aa8.11□□□□□ -1.11
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SH3BP2-209ENST00000504450 DUX5Q96PT3 197 aa8.11□□□□□ -1.11
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SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 K7EQG2 157 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 SNAI2O43623 268 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 SCGB1D1O95968 90 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 PMCHP20382 165 aa8.1□□□□□ -1.11
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SH3BP2-209ENST00000504450 SYNJ2BPP57105 145 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6ZQT7 251 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP2-209ENST00000504450 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.1□□□□□ -1.11
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