RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 NAGKQ9UJ70 344 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 X6R8D5 127 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 H7BYZ3 331 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 RGS13O14921 159 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 NMBP08949 121 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.69□□□□□ -0.86
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PGGT1B-204ENST00000503638 CRISP2P16562 243 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
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PGGT1B-204ENST00000503638 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 TENM2Q9NT68 2774 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 RYR2Q92736 4967 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.68□□□□□ -0.86
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PGGT1B-204ENST00000503638 TAS2R60P59551 318 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 PRR9Q5T870 116 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 Q86TA4 180 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 Q8NAQ8 132 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 FMC1Q96HJ9 113 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 C8orf49Q96NF6 230 aa9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 VAX2Q9UIW0 290 aa9.68□□□□□ -0.86
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PGGT1B-204ENST00000503638 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.67□□□□□ -0.86
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PGGT1B-204ENST00000503638 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB14P61106 215 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 MUC21Q5SSG8 566 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 NEU1Q99519 415 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM189A5PLL7 270 aa9.66□□□□□ -0.86
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PGGT1B-204ENST00000503638 PMS2P11Q13670 270 aa9.66□□□□□ -0.86
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PGGT1B-204ENST00000503638 C11orf45Q8TAV5 145 aa9.66□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 TVP23CQ96ET8 276 aa9.66□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.66□□□□□ -0.86
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PGGT1B-204ENST00000503638 MED9Q9NWA0 146 aa9.66□□□□□ -0.86
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PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.65□□□□□ -0.86
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PGGT1B-204ENST00000503638 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
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PGGT1B-204ENST00000503638 TNP2Q05952 138 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM183BQ1AE95 376 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 TOR2AQ5JU69 321 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 NHLRC2Q8NBF2 726 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 C16orf74Q96GX8 76 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.64□□□□□ -0.87
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PGGT1B-204ENST00000503638 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZQT7 251 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 IL17DQ8TAD2 202 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 BIRC6Q9NR09 4857 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6AWC8 147 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 BAGE2Q86Y30 109 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
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PGGT1B-204ENST00000503638 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 LTAP01374 205 aa9.62□□□□□ -0.87
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PGGT1B-204ENST00000503638 GNG4P50150 75 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 CENPWQ5EE01 88 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 PRR27Q6MZM9 219 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 MUC7Q8TAX7 377 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 C11orf52Q96A22 123 aa9.62□□□□□ -0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.62□□□□□ -0.87
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