RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495426.1

BBS9-213, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 9, human

TSL 3

Gene BBS9, Length 481 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS9-213	ENST00000495426		K7EQD1	137 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	RGS5	O15539	181 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PRAF2	O60831	178 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	CCNK	O75909	580 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	C1QB	P02746	253 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	SLA	Q13239	276 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	IL18	Q14116	193 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426		Q6ZSA8	131 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	KLLN	B2CW77	178 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426		E5RGE8	158 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426		K7EPK0	472 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	CTDSPL	O15194	276 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	OR4E1	P0C645	316 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	CD300C	Q08708	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ERCC8	Q13216	396 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	OPCML	Q14982	345 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	CTF1	Q16619	201 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426		Q9HAA7	133 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BBS9-213	ENST00000495426	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426		H3BQ15	152 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426		M0R3E3	92 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	CTDSP2	O14595	271 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	GOSR2	O14653	212 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	SSSCA1	O60232	199 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	MPDU1	O75352	247 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	OXT	P01178	125 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	TNXB	P22105	4242 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	AGPAT2	O15120	278 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	ORM1	P02763	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	GAGE1	Q13065	139 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	GAGE4	Q13068	117 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	WFDC2	Q14508	124 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	PRR9	Q5T870	116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426		C9JCJ5	164 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF253	O75346	499 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	SFT2D2	O95562	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	GPX1	P07203	203 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	CRISP2	P16562	243 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	PPT1	P50897	306 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	GUK1	Q16774	197 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426		Q6ZQT7	251 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	MGST2	Q99735	147 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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