RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa12.06□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF562Q6V9R5 426 aa12.06□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q6ZS46 218 aa12.06□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WNK1Q9H4A3 2382 aa12.06□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 K7EP34 96 aa12.06□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GAGE12HA6NDE8 117 aa12.06□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE2E1P51965 193 aa12.06□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM97Q5BJF2 176 aa12.06□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF414Q96IQ9 312 aa12.06□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF492Q9P255 531 aa12.06□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1B0GUT8 65 aa12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AAMDCQ9H7C9 122 aa12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C21orf62Q9NYP8 219 aa12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM106CPP0CH98 169 aa12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CT45A10P0DMU9 189 aa12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFAP4P55083 255 aa12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSG3Q16557 428 aa12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C15orf32Q32M92 178 aa12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SHISA2Q6UWI4 295 aa12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q8N6K4 173 aa12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM14CQ9P0S9 112 aa12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SS18L2Q9UHA2 77 aa12.05□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa12.04□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM213A2RRL7 107 aa12.04□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C9orf118A6NHY6 69 aa12.04□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCRT2Q9NQ03 307 aa12.04□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOTCH3Q9UM47 2321 aa12.04□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FASNP49327 2511 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GATA3P23771 443 aa12.04□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIR3DS1Q14943 382 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC19AQ6UXS0 136 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIMREGQ9BSJ6 248 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APOHP02749 345 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM95Q3KNT9 176 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM106AQ4KMX7 169 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTURNQ8N3F0 131 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM75Q8N9X5 138 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A6NJY4 79 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPIPB5A8MRT5 1133 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC3BP05452 202 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP5G2Q06055 141 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CT83Q5H943 113 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C10orf105Q8TEF2 133 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1RLQ9NZP8 487 aa12.03□□□□□ -0.48
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2orf91Q6ZV80 131 aa12.02□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF5Q99942 180 aa12.02□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM191AQ9H0A3 160 aa12.02□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMKR1H3BMG3 65 aa12.02□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGHV3-11P01762 117 aa12.02□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSN1S1P47710 185 aa12.02□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LYZL1Q6UWQ5 148 aa12.02□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BLCAPP62952 87 aa12.01□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HIF1ANQ9NWT6 349 aa12.01□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPIPB6E9PJ23 425 aa12.01□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTSGP08311 255 aa12.01□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPIFP30405 207 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RIGQ13278 110 aa12.01□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MINOS1Q5TGZ0 78 aa12.01□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AMN1Q8IY45 258 aa12.01□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VGLL1Q99990 258 aa12.01□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa12.01□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM189A5PLL7 270 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H3BUX3 64 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WFDC3Q8IUB2 231 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GFRA4Q9GZZ7 299 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HAX1O00165 279 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF843Q8N446 348 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF182Q8N6D2 247 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR8A1Q8NGG7 326 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH2D1AO60880 128 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FA2HQ7L5A8 372 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH2D6Q7Z4S9 175 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUX5Q96PT3 197 aa12□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 D6R8Y8 96 aa11.99□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCR2O95944 276 aa11.99□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRBV12-3P01733 135 aa11.99□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERCC8Q13216 396 aa11.99□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa11.99□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIFOQ8TCI5 191 aa11.99□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa11.99□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCGB1A1P11684 91 aa11.99□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP5S1Q9NUS5 200 aa11.99□□□□□ -0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RABAC1Q9UI14 185 aa11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms