RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488774.1

PTPRD-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRD, Length 420 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-212ENST00000488774 HBE1P02100 147 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TCRAP04437 139 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 HTN3P15516 51 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 S100A7P31151 101 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TAS2R45P59539 299 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TAS2R60P59551 318 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 RRN3P1Q2M238 152 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 STOML3Q8TAV4 291 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 FAM213BQ8TBF2 198 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 MBD3L1Q8WWY6 194 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00477Q96M19 166 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 PRELID1Q9Y255 219 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 A0A0D9SG52 128 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 SCO2A0A1W2PP80 73 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 RBAKDNA6NC62 111 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 H7BYZ3 331 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 PAGE4O60829 102 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 CXorf1O96002 111 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 AMBPP02760 352 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 GPX1P07203 203 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 SEC11BP0C7V7 166 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 DEFB130BP0DP73 79 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 DEFB130AP0DP74 79 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TSPOP30536 169 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 LEPP41159 167 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 Q6AWC8 147 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM88Q6PEY1 159 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 DPPA3Q6W0C5 159 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 S100A7AQ86SG5 101 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 AKAP14Q86UN6 197 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 LYPD1Q8N2G4 141 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM208Q9BTX3 173 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 EPDR1Q9UM22 224 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 PSG8Q9UQ74 426 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 GAGE12BA1L429 117 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 NUPR2A6NF83 97 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 PEX7O00628 323 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 GAGE7O76087 117 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPRD-212ENST00000488774 MBP02144 154 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TYMSP04818 313 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 GAGE12FP0CL80 117 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPRD-212ENST00000488774 GAGE12IP0CL82 117 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 PRNTQ86SH4 94 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 NHLRC2Q8NBF2 726 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 SFT2D1Q8WV19 159 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 DERL1Q9BUN8 251 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 Q9UF83 564 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 RNF24Q9Y225 148 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 A0A1W2PRE2 83 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 SPINK4O60575 86 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 SULT1A2P50226 295 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 DAD1P61803 113 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM183BQ1AE95 376 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 ALKAL2Q6UX46 152 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 Q86TA4 180 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM183AQ8IXX5 376 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 C16orf74Q96GX8 76 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TREM1Q9NP99 234 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 A0A0J9YY99 117 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRD-212ENST00000488774 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.53□□□□□ -1.68
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