RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 CHEK1O14757 476 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 MOSP00540 346 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 NMUP48645 174 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 Q6ZQT7 251 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 CEND1Q8N111 149 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 COQ2Q96H96 371 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 ZNF488Q96MN9 340 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 RAB9BQ9NP90 201 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 LYNX1G3V0Z9 82 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 PEX7O00628 323 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 LYNX1P0DP58 116 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 PRDX2P32119 198 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 HAX1O00165 279 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 ENSAO43768 121 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 C17orf58Q2M2W7 97 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 KLK9Q2XQG4 91 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 ZNF826PQ6ZT77 177 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 Q8N2B8 174 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 OR9G1Q8NH87 305 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 KLK9Q9UKQ9 250 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 LINC00473A8K010 186 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 C8orf88P0DMB2 117 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 CACNG7P62955 275 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 ZNF329Q86UD4 541 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 TCF19Q9Y242 345 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 PSPNO60542 156 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 AVPP01185 164 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 IGLV1-47P01700 117 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 PLCE1Q9P212 2302 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 OR2H2O95918 312 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 OXTP01178 125 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 TCTAP57738 103 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 GATD1Q8NB37 220 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 TMEM126AQ9H061 195 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 ZNF492Q9P255 531 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 METRNQ9UJH8 293 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.98□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 LTAP01374 205 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 LOXL3P58215 753 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 EBI3Q14213 229 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 RRN3P1Q2M238 152 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 C12orf74Q32Q52 190 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 MLST8Q9BVC4 326 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 ZMAT4Q9H898 229 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 UBE2E1P51965 193 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 TAL2Q16559 108 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 LINC01559Q495D7 138 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 CCL17Q92583 94 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 RITA1Q96K30 269 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.97□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.96□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.96□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.96□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 OOSP1A8MZH6 123 aa5.96□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 IFITM1P13164 125 aa5.96□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 NF1P21359 2839 aa5.96□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 P01737 135 aa5.96□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 HLA-DRB4P13762 266 aa5.96□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 LINC00205P59089 165 aa5.96□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.96□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 C16orf95Q9H693 158 aa5.96□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.96□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.96□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 FAM106CPP0CH98 169 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 MYCNOSP40205 109 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 Q5XG85 94 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 Q6YL49 198 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 C12orf77C9JDV5 145 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 GRPP07492 148 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 EVI2AP22794 236 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 HILS1P60008 231 aa5.95□□□□□ -1.46
USP4-211ENST00000485450 Q6Q795 121 aa5.95□□□□□ -1.46
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