RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 DEFB114Q30KQ6 69 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 STXBP6Q8NFX7 210 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 DYNLRB2Q8TF09 96 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 PAXXQ9BUH6 204 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 OR51M1Q9H341 326 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF586Q9NXT0 402 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 A0A087WZ39 114 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 UMAD1C9J7I0 102 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SLC17A3O00476 420 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 NMBP08949 121 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 STAG3L2P0CL84 134 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 STAG3L3P0CL85 134 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 GP9P14770 177 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 GCHFRP30047 84 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 RANP62826 216 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 HAGHQ16775 308 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 RNF182Q8N6D2 247 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 MBD3L1Q8WWY6 194 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 FXYD5Q96DB9 178 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 SORL1Q92673 2214 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 HELTA6NFD8 242 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 F8WDY8 70 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 G3V4G9 280 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 M0R3E3 92 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 CXorf1O96002 111 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV1-51P01701 117 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 NBEAP1P0C6P0 100 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF688P0C7X2 276 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 IGLC2P0DOY2 106 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 RPL7P18124 248 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 GALR1P47211 349 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 RAB5CP51148 216 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 TAS2R45P59539 299 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 KHDC3LQ587J8 217 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 DPPA3Q6W0C5 159 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF767PQ75MW2 155 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 MARC2Q969Z3 335 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00052Q96N35 136 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 RARRES2Q99969 163 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 GNG13Q9P2W3 67 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 RPH3ALQ9UNE2 315 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV19A0A075B6N1 114 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PGPA6NDG6 321 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 F6UB75 175 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 K7EQG2 157 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 CD7P09564 240 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 S100A7P31151 101 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 ATP5G3P48201 142 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 RAB14P61106 215 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 GNG5P63218 68 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PSMG4Q5JS54 123 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 S100A7AQ86SG5 101 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 APRG1Q8IVJ8 170 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 DCANP1Q8TF63 244 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 WFDC10AQ9H1F0 79 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 Q9H3A6 140 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 NRN1Q9NPD7 142 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM14CQ9P0S9 112 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 AGRNO00468 2067 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 FAM74A7A6NL05 159 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 KNCNA6PVL3 124 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 GGTLC3B5MD39 225 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 SOCS3O14543 225 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 HBE1P02100 147 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
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