RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LYPD6BQ8NI32 183 aa13.16□□□□□ -0.3
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLK9Q9UKQ9 250 aa13.16□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C11orf52Q96A22 123 aa13.16□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEP350Q5VT06 3117 aa13.16□□□□□ -0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa13.15□□□□□ -0.3
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDPF1Q6NVV7 123 aa13.15□□□□□ -0.3
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DEFB130AP0DP74 79 aa13.14□□□□□ -0.31
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C20orf144Q9BQM9 153 aa13.14□□□□□ -0.31
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLC3P0DOY3 106 aa13.12□□□□□ -0.31
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.12□□□□□ -0.31
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa13.1□□□□□ -0.31
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ESDP10768 282 aa13.09□□□□□ -0.31
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM14CQ9P0S9 112 aa13.09□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE12BA1L429 117 aa13.08□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CR1LQ2VPA4 569 aa13.08□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OCIAD2Q56VL3 154 aa13.08□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa13.08□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.08□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DTX2Q86UW9 622 aa13.08□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SDHAF1A6NFY7 115 aa13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV1-17P01599 117 aa13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLEKHB2Q96CS7 222 aa13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q96MF0 132 aa13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD5LO43866 347 aa13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COX11Q9Y6N1 276 aa13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q71RC1 249 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRIMA1Q86XR5 153 aa13.06□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DYNAPQ8N1N2 210 aa13.06□□□□□ -0.32
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