RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TMUB2Q71RG4 321 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 C11orf72Q8NBR9 251 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PRE2 83 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 CBY3A6NI87 242 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 SNURFLB1AK76 121 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 TCRAP04437 139 aa14.79□□□□□ -0.04
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ACTB-211ENST00000480301 Q6AWC8 147 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 TVP23CQ96ET8 276 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 EPDR1Q9UM22 224 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 RGS13O14921 159 aa14.78□□□□□ -0.04
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 SGK494Q96LW2 274 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 KMT2AQ03164 3969 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-211ENST00000480301 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 FHITP49789 147 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 ATP5G1P05496 136 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 ATP5G3P48201 142 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 PFDN1O60925 122 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 IGLV2-11P01706 119 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 UBE2G2P60604 165 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
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ACTB-211ENST00000480301 TREM1Q9NP99 234 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.75□□□□□ -0.05
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ACTB-211ENST00000480301 FAM74A7A6NL05 159 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 UMAD1C9J7I0 102 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 F5H768 121 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 F6UZH7 168 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 GAGE7O76087 117 aa14.74□□□□□ -0.05
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ACTB-211ENST00000480301 GAGE12GP0CL81 117 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 GAGE12IP0CL82 117 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 TCL1AP56279 114 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 MUC21Q5SSG8 566 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZTI0 123 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 PSG8Q9UQ74 426 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 K7EQM0 130 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 C1QBP02746 253 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 STOML3Q8TAV4 291 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 ATG101Q9BSB4 218 aa14.73□□□□□ -0.05
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ACTB-211ENST00000480301 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 SPINK4O60575 86 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 FAM159AQ6UWV7 190 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 LINC00479Q96M42 142 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 C8orf49Q96NF6 230 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-211ENST00000480301 TRAV21A0A0B4J279 112 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 IFNA7P01567 189 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 P0DMU3 169 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 FAM231AP0DMU4 169 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 FAM231CP0DMU5 169 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 TDRG1Q3Y452 100 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 PRNTQ86SH4 94 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 AKAP14Q86UN6 197 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 MDFICQ9P1T7 246 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF415Q09FC8 603 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 C18orf15Q96N68 181 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 PEX7O00628 323 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 NAGKQ9UJ70 344 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 TRGV11A0A075B6L2 103 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 GNRH2O43555 120 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 OR5I1Q13606 314 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 DNAH6Q9C0G6 4158 aa14.67□□□□□ -0.06
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