RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478271.1

EXOSC10-208, Transcript of exosome component 10, human

TSL 2

Gene EXOSC10, Length 608 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EXOSC10-208	ENST00000478271	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271		B4DEV8	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271		J3KRW8	73 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	CDKN1B	P46527	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	ERCC8	Q13216	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	OR5I1	Q13606	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271		Q86TA4	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	RETN	Q9HD89	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	AGRN	O00468	2067 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	TG	P01266	2768 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EXOSC10-208	ENST00000478271	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271		F6UB75	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271		H3BMM0	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	GCG	P01275	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	INS	P01308	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	LTA	P01374	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271		P01737	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	ORM1	P02763	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	S100P	P25815	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271		Q8TAT8	98 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	VGLL1	Q99990	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	UBE2C	O00762	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	RHEB	Q15382	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	C7orf71	A4D174	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271		A8MWL6	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271		H7BYZ3	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	HTN1	P15515	57 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXOSC10-208	ENST00000478271	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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