RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477187.1

C4orf17-202, Transcript of chromosome 4 open reading frame 17, humanhuman

TSL 2

Gene C4orf17, Length 1,803 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17-202ENST00000477187 COX8AP10176 69 aa6.77□□□□□ -1.33
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C4orf17-202ENST00000477187 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.72□□□□□ -1.33
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C4orf17-202ENST00000477187 Q6ZQT7 251 aa6.71□□□□□ -1.33
C4orf17-202ENST00000477187 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.71□□□□□ -1.33
C4orf17-202ENST00000477187 USMG5Q96IX5 58 aa6.71□□□□□ -1.33
C4orf17-202ENST00000477187 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.71□□□□□ -1.33
C4orf17-202ENST00000477187 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.71□□□□□ -1.33
C4orf17-202ENST00000477187 H3BUX3 64 aa6.71□□□□□ -1.34
C4orf17-202ENST00000477187 H3BVH4 76 aa6.71□□□□□ -1.34
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