RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 GTSF1Q8WW33 167 aa7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.14□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 FAM231BA6NCW3 169 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 FAM229AH3BQW9 127 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 TRGC2P03986 189 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF688P0C7X2 276 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 PAFAH1B2P68402 229 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 PSMG4Q5JS54 123 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 ZFP82Q8N141 532 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 NUP35Q8NFH5 326 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 HIVEP1P15822 2718 aa7.12□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.12□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 A0A0J9YX75 114 aa7.12□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM189A5PLL7 270 aa7.12□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 HIGD1CA8MV81 97 aa7.12□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 GZMBP10144 247 aa7.12□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 PRR9Q5T870 116 aa7.12□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.12□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 FRZBQ92765 325 aa7.12□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.11□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1B0GXF2 115 aa7.11□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.11□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 SPINK4O60575 86 aa7.11□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 CRISP2P16562 243 aa7.11□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.11□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.11□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF575Q86XF7 245 aa7.11□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 ODF3Q96PU9 254 aa7.11□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 MTORP42345 2549 aa7.11□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 TRGC1P0CF51 173 aa7.1□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 COX19Q49B96 90 aa7.1□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.1□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 RASL11AQ6T310 242 aa7.1□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.1□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.1□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.1□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.1□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.1□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.1□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.1□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.1□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 XKRY2A2RUG3 117 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 OR4C46A6NHA9 309 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 A8MTW9 85 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 SNURFLB1AK76 121 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 KLLNB2CW77 178 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 HIST1H2BKO60814 126 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 HIST1H2BJP06899 126 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 IGLC6P0CF74 106 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 HIST1H2BOP23527 126 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 HIST1H2BBP33778 126 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 HIST1H2BDP58876 126 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 DEFB131AP59861 70 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 HIST1H2BCP62807 126 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 Q6AWC8 147 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 WDR73Q6P4I2 378 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 Q6ZQT7 251 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 CITED1Q99966 193 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.09□□□□□ -1.27
SRPRB-202ENST00000466636 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.08□□□□□ -1.28
SRPRB-202ENST00000466636 KNCNA6PVL3 124 aa7.08□□□□□ -1.28
SRPRB-202ENST00000466636 SAP30O75446 220 aa7.08□□□□□ -1.28
SRPRB-202ENST00000466636 IGLV1-51P01701 117 aa7.08□□□□□ -1.28
SRPRB-202ENST00000466636 ORM1P02763 201 aa7.08□□□□□ -1.28
SRPRB-202ENST00000466636 MT-ND6P03923 174 aa7.08□□□□□ -1.28
SRPRB-202ENST00000466636 CTRLP40313 264 aa7.08□□□□□ -1.28
SRPRB-202ENST00000466636 LEPP41159 167 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms