RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.36□□□□□ -0.91
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C9orf3-210ENST00000462125 TMEM250H0YL14 139 aa9.36□□□□□ -0.91
C9orf3-210ENST00000462125 STAG3L2P0CL84 134 aa9.36□□□□□ -0.91
C9orf3-210ENST00000462125 STAG3L3P0CL85 134 aa9.36□□□□□ -0.91
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C9orf3-210ENST00000462125 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 TVP23CQ96ET8 276 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 C16orf74Q96GX8 76 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.33□□□□□ -0.92
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C9orf3-210ENST00000462125 RNF212Q495C1 297 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.32□□□□□ -0.92
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C9orf3-210ENST00000462125 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.32□□□□□ -0.92
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C9orf3-210ENST00000462125 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.31□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.31□□□□□ -0.92
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C9orf3-210ENST00000462125 PAGE4O60829 102 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 BLNKQ8WV28 456 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 FXYD5Q96DB9 178 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.3□□□□□ -0.92
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C9orf3-210ENST00000462125 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.3□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 NAT8Q9UHE5 227 aa9.3□□□□□ -0.92
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C9orf3-210ENST00000462125 KLLNB2CW77 178 aa9.29□□□□□ -0.92
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C9orf3-210ENST00000462125 CEBPGP53567 150 aa9.29□□□□□ -0.92
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C9orf3-210ENST00000462125 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.29□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 FAM74A7A6NL05 159 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 CRISP2P16562 243 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 CST9LP1Q5W188 147 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF503Q96F45 646 aa9.28□□□□□ -0.92
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