RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 ARL3P36405 182 aa15.68■□□□□ 0.1
IMP4-208ENST00000460766 FOXE3Q13461 319 aa15.68■□□□□ 0.1
IMP4-208ENST00000460766 C18orf15Q96N68 181 aa15.68■□□□□ 0.1
IMP4-208ENST00000460766 VPS13CQ709C8 3753 aa15.68■□□□□ 0.1
IMP4-208ENST00000460766 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
IMP4-208ENST00000460766 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa15.67■□□□□ 0.1
IMP4-208ENST00000460766 Q6ZQT7 251 aa15.67■□□□□ 0.1
IMP4-208ENST00000460766 C2orf91Q6ZV80 131 aa15.67■□□□□ 0.1
IMP4-208ENST00000460766 TAX1BP3O14907 124 aa15.67■□□□□ 0.1
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IMP4-208ENST00000460766 DEFB125Q8N687 156 aa15.67■□□□□ 0.1
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IMP4-208ENST00000460766 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa15.64■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 CBY3A6NI87 242 aa15.64■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 J3KRW8 73 aa15.64■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa15.64■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 FGF6P10767 208 aa15.64■□□□□ 0.09
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IMP4-208ENST00000460766 OR1N2Q8NGR9 330 aa15.64■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 DKK2Q9UBU2 259 aa15.64■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 C20orf173Q96LM9 149 aa15.63■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 ATP6V0BQ99437 205 aa15.63■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 CCL19Q99731 98 aa15.63■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 C9orf139Q6ZV77 190 aa15.63■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 FCER1GP30273 86 aa15.62■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 SPANXN1Q5VSR9 72 aa15.62■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa15.62■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 IGHV3-11P01762 117 aa15.62■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 PRR9Q5T870 116 aa15.62■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 MEGF9Q9H1U4 602 aa15.62■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 LINC01546A6NGU7 62 aa15.61■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 OR2K2Q8NGT1 345 aa15.61■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 H3BUX3 64 aa15.61■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 IGF1P05019 195 aa15.61■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 NMUP48645 174 aa15.61■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 OR4C5Q8NGB2 326 aa15.61■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa15.61■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
IMP4-208ENST00000460766 H3BVH4 76 aa15.6■□□□□ 0.09
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IMP4-208ENST00000460766 C10orf105Q8TEF2 133 aa15.6■□□□□ 0.09
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IMP4-208ENST00000460766 COL12A1Q99715 3063 aa15.6■□□□□ 0.09
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IMP4-208ENST00000460766 RPL11P62913 178 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
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IMP4-208ENST00000460766 TMEM158Q8WZ71 300 aa15.6■□□□□ 0.09
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IMP4-208ENST00000460766 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa15.57■□□□□ 0.08
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IMP4-208ENST00000460766 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa15.56■□□□□ 0.08
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IMP4-208ENST00000460766 LINC00477Q96M19 166 aa15.56■□□□□ 0.08
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IMP4-208ENST00000460766 ODF1Q14990 250 aa15.56■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa15.55■□□□□ 0.08
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IMP4-208ENST00000460766 SEC11AP67812 179 aa15.55■□□□□ 0.08
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IMP4-208ENST00000460766 SELENOKQ9Y6D0 94 aa15.55■□□□□ 0.08
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IMP4-208ENST00000460766 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.55■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 FOXC2Q99958 501 aa15.55■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 NDUFS8O00217 210 aa15.54■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 SOCS3O14543 225 aa15.54■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 SPRY2O43597 315 aa15.54■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 SMIM17P0DL12 118 aa15.54■□□□□ 0.08
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