RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 PRELID3AQ96N28 172 aa-0.31□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 MYH3P11055 1940 aa-0.31□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 NCOR2Q9Y618 2525 aa-0.31□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 ANK2Q01484 3957 aa-0.31□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 DLC1Q96QB1 1528 aa-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 TANC1Q9C0D5 1861 aa-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 ARL5CA6NH57 179 aa-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 IGF2P01344 180 aa-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 TFF1P04155 84 aa-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 MPC1LP0DKB6 136 aa-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 BCL2P10415 239 aa-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 TPT1P13693 172 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 S100A11P31949 105 aa-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 LYPD5Q6UWN5 251 aa-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 KNTC1P50748 2209 aa-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa-0.32□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 ADGBQ8N7X0 1667 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 RREB1Q92766 1687 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 TANC2Q9HCD6 1990 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 A0A096LNT2 108 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 HIGD1CA8MV81 97 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 SLC25A4P12235 298 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 SDC2P34741 201 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 CRYBA4P53673 196 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 LINC00305Q7Z4B0 112 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 STX19Q8N4C7 294 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 MNS1Q8NEH6 495 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 AP3S1Q92572 193 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 MCEEQ96PE7 176 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 TMEM14BQ9NUH8 114 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 FAM135BQ49AJ0 1406 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 FLNCQ14315 2725 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.33□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 A0A0G2JMM0 328 aa-0.34□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 TPST1O60507 370 aa-0.34□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 BLCAPP62952 87 aa-0.34□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-0.34□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 BIN3Q9NQY0 253 aa-0.34□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 GID8Q9NWU2 228 aa-0.34□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 MPC1Q9Y5U8 109 aa-0.34□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 U3KQA8 63 aa-0.34□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 TTC28Q96AY4 2481 aa-0.35□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.46
TTC3-211ENST00000460328 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 TMEM189A5PLL7 270 aa-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 M0QZK8 103 aa-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 E2F6O75461 281 aa-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 CRYGSP22914 178 aa-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 G0S2P27469 103 aa-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 DNAJB13P59910 316 aa-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 KLKP1Q107X0 134 aa-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 OR8J3Q8NGG0 315 aa-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 OR5A2Q8NGI9 324 aa-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 STOML2Q9UJZ1 356 aa-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa-0.36□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa-0.36□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-0.36□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 TMEM238C9JI98 176 aa-0.36□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 H3BMG7 143 aa-0.36□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 CCKP06307 115 aa-0.36□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 TCTAP57738 103 aa-0.36□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 RHOHQ15669 191 aa-0.36□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 TMED4Q7Z7H5 227 aa-0.36□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 MORN4Q8NDC4 146 aa-0.36□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 CDC26Q8NHZ8 85 aa-0.36□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 ISOC1Q96CN7 298 aa-0.36□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-0.36□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 LRP5O75197 1615 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 PPP5D1E7EU14 171 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 SERPINB1P30740 379 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 C3orf33Q6P1S2 294 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 STX12Q86Y82 276 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 OTOSQ8NHW6 89 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 BRK1Q8WUW1 75 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 DMAC1Q96GE9 116 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 SMIM7Q9BQ49 75 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 ATG5Q9H1Y0 275 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 CBLN4Q9NTU7 201 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 IGF2RP11717 2491 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 DLEC1Q9Y238 1755 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 PIEZO1Q92508 2521 aa-0.37□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
TTC3-211ENST00000460328 IFITM5A6NNB3 132 aa-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms