RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 DYNLRB2Q8TF09 96 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-202ENST00000453996 BAHCC1Q9P281 2608 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-202ENST00000453996 FABP5P3A8MUU1 101 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-202ENST00000453996 PSMG4Q5JS54 123 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-202ENST00000453996 GNB1LQ9BYB4 327 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-202ENST00000453996 XKRY2A2RUG3 117 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 SNURFLB1AK76 121 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 RASL11AQ6T310 242 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 MT-ND6P03923 174 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 PGLYRP4Q96LB8 373 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 A0A1B0GUS0 222 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 TRAV2A0A0B4J234 112 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 RPS20P60866 119 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 Q6AWC8 147 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 TMEM136Q6ZRR5 245 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 F8P00451 2351 aa15.99■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa15.99■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 RAB4BP61018 213 aa15.99■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa15.99■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 TMEM61Q8N0U2 210 aa15.99■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa15.98■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 A0A1B0GXF2 115 aa15.98■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.98■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 FAM19A4Q96LR4 140 aa15.98■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 C5orf52A6NGY3 159 aa15.98■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 HLA-DQA1P01909 254 aa15.98■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 ORM1P02763 201 aa15.98■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 NDUFA6P56556 154 aa15.98■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 KRTAP10-3P60369 221 aa15.98■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 LINC01559Q495D7 138 aa15.98■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 NDUFA11Q86Y39 141 aa15.98■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.98■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.97■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 HBBP68871 147 aa15.97■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 PRR9Q5T870 116 aa15.97■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa15.97■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 A0A0J9YX75 114 aa15.96■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 EBLN2Q6P2I7 272 aa15.96■□□□□ 0.15
CTU2-202ENST00000453996 CRISP2P16562 243 aa15.95■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 GDF5OSQ5U4N7 250 aa15.95■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 TPPP3Q9BW30 176 aa15.95■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 A0A1B0GUT8 65 aa15.95■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 CAMPP49913 170 aa15.95■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 TRAV25A0A0B4J276 109 aa15.94■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 J3KRW8 73 aa15.94■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 GPX1P07203 203 aa15.94■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 CD33P20138 364 aa15.94■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 APRG1Q8IVJ8 170 aa15.94■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 BORCS7Q96B45 105 aa15.94■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 UBE2CO00762 179 aa15.93■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 FOXI2Q6ZQN5 318 aa15.93■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 ODF3Q96PU9 254 aa15.93■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 C11orf21Q9P2W6 132 aa15.93■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 WNK1Q9H4A3 2382 aa15.93■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 OR4C46A6NHA9 309 aa15.92■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 ARMS2P0C7Q2 107 aa15.92■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 TRAV21A0A0B4J279 112 aa15.92■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa15.92■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 APCSP02743 223 aa15.92■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 RIGQ13278 110 aa15.92■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 LYZL1Q6UWQ5 148 aa15.92■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa15.92■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 A0A1B0GW15 77 aa15.91■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 IGLC6P0CF74 106 aa15.91■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 CTRLP40313 264 aa15.91■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 LEPP41159 167 aa15.91■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 ZNF575Q86XF7 245 aa15.91■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 GRIFINA4D1Z8 144 aa15.9■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 KLLNB2CW77 178 aa15.9■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 S100A8P05109 93 aa15.9■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 DEFB131AP59861 70 aa15.9■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 Q6ZQT7 251 aa15.9■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 HOXA5P20719 270 aa15.9■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 SLAQ13239 276 aa15.9■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CTU2-202ENST00000453996 SAP30O75446 220 aa15.89■□□□□ 0.13
CTU2-202ENST00000453996 IGKV3-20P01619 116 aa15.88■□□□□ 0.13
CTU2-202ENST00000453996 MAP6D1Q9H9H5 199 aa15.88■□□□□ 0.13
CTU2-202ENST00000453996 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CTU2-202ENST00000453996 PF4P02776 101 aa15.87■□□□□ 0.13
CTU2-202ENST00000453996 KIR3DS1Q14943 382 aa15.87■□□□□ 0.13
CTU2-202ENST00000453996 KIAA1644Q3SXP7 199 aa15.87■□□□□ 0.13
CTU2-202ENST00000453996 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTU2-202ENST00000453996 NAGKQ9UJ70 344 aa15.87■□□□□ 0.13
CTU2-202ENST00000453996 CYSRT1A8MQ03 144 aa15.87■□□□□ 0.13
CTU2-202ENST00000453996 F2Z2F3 143 aa15.86■□□□□ 0.13
CTU2-202ENST00000453996 HLA-DRB4P13762 266 aa15.86■□□□□ 0.13
CTU2-202ENST00000453996 TSPOP30536 169 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.7 ms