RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-209ENST00000439106 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.63□□□□□ -0.87
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PRAME-209ENST00000439106 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-209ENST00000439106 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.63□□□□□ -0.87
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PRAME-209ENST00000439106 C6orf223Q8N319 242 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 TREM1Q9NP99 234 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.54□□□□□ -0.88
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PRAME-209ENST00000439106 TCRAP04437 139 aa9.54□□□□□ -0.88
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PRAME-209ENST00000439106 SERF2P84101 59 aa9.54□□□□□ -0.88
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PRAME-209ENST00000439106 ZNF479Q96JC4 524 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 ARPC5O15511 151 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 MBP02144 154 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 CRYBA4P53673 196 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 TMEM75Q8N9X5 138 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 SUN5Q8TC36 379 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 ASB13Q8WXK3 278 aa9.53□□□□□ -0.88
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