RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF738Q8NE65 137 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 NUPR2A6NF83 97 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 A8MTW9 85 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 PRAC2D3DTV9 90 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 F8W036 122 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 ATP5G3P48201 142 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 SMIM12Q96EX1 92 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 Q9H3A6 140 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 RBAKDNA6NC62 111 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 B4DEV8 164 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 C9JCJ5 164 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 ADCYAP1P18509 176 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 EMP1P54849 157 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 UBE2G2P60604 165 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 BLNKQ8WV28 456 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 ATG101Q9BSB4 218 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-216ENST00000428482 TCRAP04437 139 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 MIFP14174 115 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 ID1P41134 155 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 SVBPQ8N300 66 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 PARLQ9H300 379 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF727A8MUV8 499 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 DIRC3C9JPN6 131 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 K7EQM0 130 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 M0R3E3 92 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 PEX7O00628 323 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 LY6G6CO95867 125 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 CSN1S1P47710 185 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 PSG3Q16557 428 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 C12orf74Q32Q52 190 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 FMC1Q96HJ9 113 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 NAT8Q9UHE5 227 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 J3KRW8 73 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 SNAPINO95295 136 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV2-11P01706 119 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 TVP23CQ96ET8 276 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 MLST8Q9BVC4 326 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 NACAE9PAV3 2078 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 A0A087WWC5 75 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 INSP01308 110 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 APOC3P02656 99 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 PRR9Q5T870 116 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 OCC1Q8TAD7 63 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00477Q96M19 166 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 BIN3Q9NQY0 253 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 RYR1P21817 5038 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 LTAP01374 205 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV2-8P01709 118 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 AZU1P20160 251 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 ERCC8Q13216 396 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 RHEBQ15382 184 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.29□□□□□ -1.24
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