RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421185.1

RTCA-AS1-201, RTCA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RTCA-AS1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RHOHQ15669 191 aa5.35□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RGS21Q2M5E4 152 aa5.35□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PACRGLQ8N7B6 248 aa5.35□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.35□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZFAND1Q8TCF1 268 aa5.35□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KLK12Q9UKR0 248 aa5.35□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TPRKBQ9Y3C4 175 aa5.35□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CRISP2P16562 243 aa5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PLP1P60201 277 aa5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GUK1Q16774 197 aa5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OR52I2Q8NH67 350 aa5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 Q8TAT8 98 aa5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 VCX2Q9H322 139 aa5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RBKSQ9H477 322 aa5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 S100A14Q9HCY8 104 aa5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NDUFB11Q9NX14 153 aa5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.34□□□□□ -1.55
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ANKRD65E5RJM6 399 aa5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 APOA1P02647 267 aa5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCR6P51684 374 aa5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SELENOTP62341 195 aa5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KCNIP4Q6PIL6 250 aa5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NIT1Q86X76 327 aa5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LINC00479Q96M42 142 aa5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SRRQ9GZT4 340 aa5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DUSP21Q9H596 190 aa5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PGPA6NDG6 321 aa5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 M0R2P5 195 aa5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TNFAIP8O95379 198 aa5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SMIM18P0DKX4 95 aa5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PCP4P48539 62 aa5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 VBP1P61758 197 aa5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AKR1C1Q04828 323 aa5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMEM268Q5VZI3 342 aa5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MITD1Q8WV92 249 aa5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 YIPF6Q96EC8 236 aa5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TREM1Q9NP99 234 aa5.32□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 A0A087WWL8 130 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 A0A087WX48 190 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLC17A3O00476 420 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF253O75346 499 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LINC00869P0C866 280 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AKR1C4P17516 323 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ERCC8Q13216 396 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 Q6ZQT7 251 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PRSS48Q7RTY5 328 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GPX8Q8TED1 209 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ARV1Q9H2C2 271 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MUC17Q685J3 4493 aa5.31□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 H3BTX0 84 aa5.3□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CACNG7P62955 275 aa5.3□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SMCO1Q147U7 214 aa5.3□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.3□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LHFPL1Q86WI0 220 aa5.3□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 STX12Q86Y82 276 aa5.3□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa5.3□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.3□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.3□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ARL6Q9H0F7 186 aa5.3□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PAGE4O60829 102 aa5.29□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CHTF8P0CG12 524 aa5.29□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SDC2P34741 201 aa5.29□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ID3Q02535 119 aa5.29□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MXD1Q05195 221 aa5.29□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.29□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MUC21Q5SSG8 566 aa5.29□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.29□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM159AQ6UWV7 190 aa5.29□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PATE2Q6UY27 113 aa5.29□□□□□ -1.56
RTCA-AS1-201ENST00000421185 Q6ZRP5 223 aa5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms