RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GV72 72 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRJ-201ENST00000418331 GAGE12JA6NER3 117 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRJ-201ENST00000418331 H3BUA1 57 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRJ-201ENST00000418331 GAGE1Q13065 139 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRJ-201ENST00000418331 GAGE4Q13068 117 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRJ-201ENST00000418331 GAGE5Q13069 117 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRJ-201ENST00000418331 CST9LQ9H4G1 147 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRJ-201ENST00000418331 SDHAF1A6NFY7 115 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRJ-201ENST00000418331 KIR3DS1Q14943 382 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRJ-201ENST00000418331 DEFB112Q30KQ8 113 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRJ-201ENST00000418331 GATD1Q8NB37 220 aa16.89■□□□□ 0.3
PTPRJ-201ENST00000418331 C17orf77Q96MU5 243 aa16.89■□□□□ 0.3
PTPRJ-201ENST00000418331 CFHR3Q02985 330 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 SS18Q15532 418 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 ASPHD1Q5U4P2 390 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 LYPD6BQ8NI32 183 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 SEM1Q6ZVN7 128 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 C2orf16Q68DN1 1984 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 I3L3M4 83 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV4-59P01825 116 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 C20orf144Q9BQM9 153 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 DLEU1O43261 78 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 AZU1P20160 251 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 IGFBPL1Q8WX77 278 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM141Q96I45 108 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 LTAP01374 205 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 VPREB3Q9UKI3 123 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 HLA-DMBP28068 263 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 PLCE1Q9P212 2302 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 Q71RC1 249 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 CUL9Q8IWT3 2517 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 K7EN84 100 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 CD5LO43866 347 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 PMVKQ15126 192 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 NPYP01303 97 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 Q6ZWC4 215 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 GAGE12BA1L429 117 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 LEPROTO15243 131 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 GAGE7O76087 117 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 GAGE12FP0CL80 117 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 GAGE12GP0CL81 117 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 GAGE12IP0CL82 117 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 DAD1P61803 113 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 ADORA2A-AS1P86434 159 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 COL4A3Q01955 1670 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 F5H768 121 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 DYNAPQ8N1N2 210 aa16.83■□□□□ 0.29
PTPRJ-201ENST00000418331 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP6V0BQ99437 205 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 FREM1Q5H8C1 2179 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 NPBQ8NG41 125 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNRF2Q8NHG8 242 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 SMIM2Q9BVW6 85 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 NEGR1Q7Z3B1 354 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 F6UB75 175 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 RITA1Q96K30 269 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 EML6Q6ZMW3 1958 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 WISP2O76076 250 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 LTBP2Q14767 1821 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 I3L2K1 104 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 K7EIM0 57 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 EREGO14944 169 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 SIGMAR1Q99720 223 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 CACNA1AO00555 2505 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV1-17P01599 117 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 UBE2V1Q13404 147 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 C2orf82Q6UX34 121 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 PSCAO43653 123 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 PYGO2Q9BRQ0 406 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 LGALS9BQ3B8N2 356 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 LGALS9CQ6DKI2 356 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLC2P0DOY2 106 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLC3P0DOY3 106 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXI2Q6ZQN5 318 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 DEFB113Q30KQ7 82 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM243Q9BU79 118 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-201ENST00000418331 PRB1P04280 392 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXE3Q13461 319 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-201ENST00000418331 LENEPQ9Y5L5 61 aa16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms